24小时热门版块排行榜    

查看: 1821  |  回复: 19
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xzh410512206

银虫 (小有名气)

[求助] 求助:对称有机大分子体系 如何同时扫描4个势能面??? 已有1人参与

我要同时扫描4个二面角(分别是4-3-2-1,8-7-6-5,12-11-10-9,16-15-14-13) 用g09 scan模块只有扫描一个角度的方法,如果我同时扫描4个角度,并进行优化,也就是柔性扫描,,我该怎么设置呢??我自己尝试的结果是 只有两个角度在变,另外俩几乎无变化。。。。
有没有哪位大侠 做过类似方面的? 急求。。。

求助:对称有机大分子体系  如何同时扫描4个势能面???
对称分子.png
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xzh410512206 at 2015-07-15 10:51:13
首先谢谢亲回复我。
是的,同时扫描4个角度,结构对称,角度变化应该也同步吧?这样就可以绘制角度和能量曲线。 关键问题是扫描时  是怎么设置?  或者 有什么其他方法吗?
我看到有的文献关于对称型分子,扫描势 ...

从来没做过同步变化的扫描。。。把你做的输出文件贴上来看看?
4楼2015-07-15 12:49:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 20 个回答

枪下游魂

木虫 (著名写手)

是要同时扫4个角度吗?就是说4个二面角一起变化?
高斯扫描都是一个角一个角变的。。。
2楼2015-07-15 10:32:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xzh410512206

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-07-15 10:32:57
是要同时扫4个角度吗?就是说4个二面角一起变化?
高斯扫描都是一个角一个角变的。。。

首先谢谢亲回复我。
是的,同时扫描4个角度,结构对称,角度变化应该也同步吧?这样就可以绘制角度和能量曲线。 关键问题是扫描时  是怎么设置?  或者 有什么其他方法吗?
我看到有的文献关于对称型分子,扫描势能面,而且他只用了高斯这一个软件。
3楼2015-07-15 10:51:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xzh410512206

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-07-15 12:49:02
从来没做过同步变化的扫描。。。把你做的输出文件贴上来看看?...

好的    三个图。
9-1和9-2 是我编辑的输入文本,我是自己仿照着扫描一个角度的格式来的。9-3是从输出的log文件查看每一步角度变化,,可以看出只有4-3-2-1这个二面角在按要求变化,,其他3个是怎么回事?   我的输入格式  可以怎么改进呢?
求助:对称有机大分子体系  如何同时扫描4个势能面???-1
9—1.png


求助:对称有机大分子体系  如何同时扫描4个势能面???-2
9-2.png


求助:对称有机大分子体系  如何同时扫描4个势能面???-3
9-3.jpg

5楼2015-07-15 14:32:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂 +7 18419759900 2026-03-25 7/350 2026-03-26 16:07 by 不吃魚的貓
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +4 李李不服输 2026-03-26 4/200 2026-03-26 16:00 by 不吃魚的貓
[考研] 0856求调剂 +8 zhn03 2026-03-25 9/450 2026-03-26 13:42 by zzll406
[考研] 环境专硕324分求调剂推荐 +5 轩小宁—— 2026-03-26 5/250 2026-03-26 12:05 by i_cooler
[考研] 332求调剂 +6 032500 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:45 by 418490947
[考研] 359求调剂 +3 王了个楠 2026-03-25 3/150 2026-03-25 12:50 by Dyhoer
[考研] 一志愿南航材料专317分求调剂 +5 炸呀炸呀炸薯条 2026-03-23 5/250 2026-03-24 16:52 by 星空星月
[考研] 材料292调剂 +8 橘颂思美人 2026-03-23 8/400 2026-03-24 16:33 by laoshidan
[考研] 一志愿山东大学药学学硕求调剂 +3 开开心心没烦恼 2026-03-23 4/200 2026-03-24 00:06 by 开开心心没烦恼
[考研] 335求调剂 +4 yuyu宇 2026-03-23 5/250 2026-03-23 23:49 by Txy@872106
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 接收2026硕士调剂(学硕+专硕) +4 allen-yin 2026-03-23 6/300 2026-03-23 15:04 by 汪!?!
[考研] 291求调剂 +5 孅華 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:20 by haoshis
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:09 by 星空星月
[考研] 初试 317 +7 半拉月丙 2026-03-20 7/350 2026-03-21 22:26 by peike
[考研] 0703化学297求调剂 +3 Daisy☆ 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:45 by ColorlessPI
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
[考研] 求调剂 +3 eation27 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:32 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见