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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 实验技术 » 求助~根系分析~根系形态观察~根系指标的检测相关的
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jessica603

铁虫 (初入文坛)

[求助] 求助~根系分析~根系形态观察~根系指标的检测相关的已有2人参与

本人在做的是模式植物蒺藜苜蓿，现在想观察它的根。初步的想法是用琼脂糖培养。因为我觉得琼脂糖可以很清楚的看出根的生长状况。
但是，我对于琼脂糖培养植物并且要观察它的根系没有任何经验，有没有人做过相关的类似植物培养，能不能给我一些经验?我担心琼脂糖培养植物不能长大吗，然后也不知道怎么配比 需要注意一些什么
还有，根系观察 看到小木虫上有人在用根系分析软件。然而老师肯定不会给钱让我去买这一套软件（有点贵），现有的只有办公室通用的扫描仪器可以用，有没有只用扫描仪器就可以计算出根系指标的相关量，比如根长，侧根数目，根尖数目等等

有点多 不知道你们能不能看懂
请教
1琼脂糖种植物方法
2根系观察的方法(实验室只有办公用的扫描仪)

谢谢啦，真的很着急，新人，特地注册帐号来的，谢谢这里的前辈们 我的金币只有这么多了。。。。。。
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1楼2015-07-14 20:40:35
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jessica603

铁虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by starseacow at 2015-07-15 16:01:53
试试这个吧
http://psrg.org.uk/plant-biometrics/

做法可以参考
Kellermeier, F., Armengaud, P., Seditas, T. J., Danku, J., Salt, D. E., and Amtmann, A. (2014) Analysis of the root system architectu ...

谢谢你~但是你有自己试过这个软件吗？其实之前在小木虫上搜到过，我觉得难道是我的问题吗？不能用啊

[ 发自小木虫客户端 ]
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5楼2015-07-16 16:39:34
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普通回帖

wuzhaoxiang

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
第二个问题很好解决，直接用办公室的普通扫描仪扫图后找个有软件的试验帮忙分析一下就好了。
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2楼2015-07-15 08:58:22
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jessica603

铁虫 (初入文坛)
内容已删除
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3楼2015-07-15 09:49:48
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
试试这个吧
http://psrg.org.uk/plant-biometrics/

做法可以参考
Kellermeier, F., Armengaud, P., Seditas, T. J., Danku, J., Salt, D. E., and Amtmann, A. (2014) Analysis of the root system architecture of Arabidopsis provides a quantitative readout of crosstalk between nutritional signals. Plant Cell, 26(4), pp. 1480-1490.
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jessica603
植物生理群69993869，为避免广告，申请加入请提供木虫昵称，院校及专业信息
4楼2015-07-15 16:01:53
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starseacow

专家顾问 (职业作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jessica603 at 2015-07-16 16:39:34
谢谢你~但是你有自己试过这个软件吗？其实之前在小木虫上搜到过，我觉得难道是我的问题吗？不能用啊
...

我自己看过别人怎么用，目前已知的问题是在win 8和部分win 7上有问题，可能与某个windows升级有关。开发者目前也没有时间升级解决这个问题。
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植物生理群69993869，为避免广告，申请加入请提供木虫昵称，院校及专业信息
6楼2015-07-16 16:52:33
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jessica603

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by starseacow at 2015-07-16 16:52:33
我自己看过别人怎么用，目前已知的问题是在win 8和部分win 7上有问题，可能与某个windows升级有关。开发者目前也没有时间升级解决这个问题。...

不好意思 您还在吗
最近我在用您分享的EZ-RHIZO  可是出了一些问题 似乎不能用 给你看看可以不~
我的根本来是这个样子的
处理之后，就是在skeletonize之后的那一步之后就成了那个样子
（附件两张图）
我就无法继续下一步了，这是怎么原因呢 怎么连根的基本形态都不能保持呢

我记得您还在其他的一个帖子上发过一个研发者的邮箱，我把这个问题发给他们的邮箱了，一直在等答复也还没等到，所以索性试试过来再问问你这是什么原因，怎么处理呀 还能继续下一步吗。不知道您会不会知道 打扰啦
求助~根系分析~根系形态观察~根系指标的检测相关的
本来的根.jpg


求助~根系分析~根系形态观察~根系指标的检测相关的-1
skeletonize那一步之后的根.png
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7楼2015-07-27 22:07:40
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qijinyu

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by jessica603 at 2015-07-27 22:07:40
不好意思 您还在吗
最近我在用您分享的EZ-RHIZO  可是出了一些问题 似乎不能用 给你看看可以不~
我的根本来是这个样子的
处理之后，就是在skeletonize之后的那一步之后就成了那个样子
（附件两张图）
我就无 ...

我最近想做植物根系比较，请问你的用扫描仪扫描根就直接扫描吗？软件好用吗？最后做出来了吗？

发自小木虫Android客户端
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8楼2015-11-25 21:46:38
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puxinyue

新虫 (著名写手)
拍照片行吗？

发自小木虫Android客户端
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9楼2015-11-26 00:40:15
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slotsma

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by jessica603 at 2015-07-27 22:07:40
不好意思 您还在吗
最近我在用您分享的EZ-RHIZO  可是出了一些问题 似乎不能用 给你看看可以不~
我的根本来是这个样子的
处理之后，就是在skeletonize之后的那一步之后就成了那个样子
（附件两张图）
我就无 ...

先去学一点图像处理基础知识，扫出来的图像没法直接用，要先进行处理。（不用回复我）

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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10楼2015-11-27 00:22:25
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