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吉米爱多

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] GROMACS中,怎么样将TIP4P水模型的参数修正,得到TIP4P/ICE的水模型? 已有1人参与

附件中,tip4p.itp是gromacs软件自带的水分子的一种模型,param这张图是文献中不同水模型的参数。现在我知道怎么样修改q,epsilon和sigma参数了,而且键角L(H-O-H)和氧氢原子距离d(O-H)也不用修改,只需要添加一项d(O-M)到itp文件中应该就可以了。但是软件自带的tip4p.itp中,只限制了d(O-H)和d(H-H),并未限制O-M原子间距离。那么O-M这一项应该怎么添加呢?
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  • 附件 1 : param.jpg
  • 2015-07-13 15:51:07, 290.1 K

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吉米爱多

铁杆木虫 (著名写手)

http://pan.baidu.com/s/1i3L9W3N 这个是gromacs自带的tip4p水模型的itp文件
2楼2015-07-13 16:01:56
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
吉米爱多: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2015-07-16 09:15:02
群132266540中有人可以帮你
3楼2015-07-14 09:26:42
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实验准备中

金虫 (小有名气)

不明觉厉系列
4楼2015-07-15 18:06:09
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