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吉米爱多铁杆木虫 (著名写手)
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GROMACS中，怎么样将TIP4P水模型的参数修正，得到TIP4P/ICE的水模型？ 已有1人参与
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| 附件中，tip4p.itp是gromacs软件自带的水分子的一种模型，param这张图是文献中不同水模型的参数。现在我知道怎么样修改q,epsilon和sigma参数了，而且键角L(H-O-H)和氧氢原子距离d(O-H)也不用修改，只需要添加一项d(O-M)到itp文件中应该就可以了。但是软件自带的tip4p.itp中，只限制了d(O-H)和d(H-H)，并未限制O-M原子间距离。那么O-M这一项应该怎么添加呢？ |
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2015-07-13 15:51:07, 290.1 K
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