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关于一篇文献，有一些问题求各位大侠解答 已有2人参与
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本人是菜鸟，还没入分子动力学模拟的门，最近看了一篇论文，有一些问题求解答。 （附件即为论文） 问题： 1、我自己构建反应物、生成物。一定要进行结构优化么？ 2、文中的中间态、过渡态感觉都是自己设计的，还是计算出的？ 3、对于反应式：A+B-->C+D，GVIEW寻找过渡态时A+B放在一起运算时为啥总是报错？#2070 最后，各位对这篇论文有没有什么见解，我想重复一下模拟过程，希望能交流一下，多谢 |
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本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 煤中苯硫酚型有机硫与O_2反应机理.pdf
2015-07-12 15:47:21, 1.34 M
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
俊俊好可爱: 金币+15, ★★★很有帮助 2015-07-13 12:21:54
感谢参与，应助指数 +1
俊俊好可爱: 金币+15, ★★★很有帮助 2015-07-13 12:21:54
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1、我自己构建反应物、生成物。一定要进行结构优化么？ 需要进行结构优化。 2、文中的中间态、过渡态感觉都是自己设计的，还是计算出的？ 你不知道过渡态的情况下是计算出的； 你也可以自己设计一个过渡态，然后放到计算中看你猜想的是否正确。 3、对于反应式：A+B-->C+D，GVIEW寻找过渡态时A+B放在一起运算时为啥总是报错？#2070 大部分错误都报2070，需要具体的出错原因才好分析。 可能是由于A,B 和C,D中的原子顺序没有一致，或者没有用qst2等等。 |
4楼2015-07-13 07:45:45
