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依熊若蜜

新虫 (初入文坛)

[求助] popgen软件中，SSR标记的聚丙烯电泳条带怎么统计 已有1人参与

大家好，我用SSR做遗传关系分析，现在胶都跑好了，就是因为不会分析，半个月了一直弄不明白，很崩溃。popgen这个软件，计算各种群的Nei’S遗传多样性指数(H)、Shannon多样性指数(I)、多态位点百分率(PPB)、遗传分化系数(Gst)、基因流0．5(1一Gst)／Gst、总基因多样性(Hs)和种群内基因多样性(Ht),,,,,,
popgen这个软件中，SSR标记是要用ABCD来统计条带的，但是我一直都弄不明白，怎么统计。希望各位高人能帮帮我！！！另附一张图，给我举个例子就好，非常感谢！！！

popgen软件中，SSR标记的聚丙烯电泳条带怎么统计
ca23.jpg
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1楼 2015-07-06 17:25:53
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依熊若蜜

新虫 (初入文坛)
怎么没人回答尼
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3楼2015-07-07 08:13:48
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bigenid

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你的最左边和最右边是MARKER吧，首先找到你的基因所在的片段范围，然后按照基因大小进行编号，如：AA，BB,CC,DD,EE,杂合子AB,CD,等等，一个一个的编。还有你做单倍体，还是二倍体啊？我做的单倍体，一直还在摸索中。
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继续努力
5楼2015-08-31 12:53:52
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ufo29119690

金虫 (小有名气)
从左至右  AA BB CC DD EE BB BB BB BB EE BB FF CC GC HB
popgen软件中，SSR标记的聚丙烯电泳条带怎么统计-1



发自小木虫Android客户端
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6楼2015-08-31 14:49:10
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kxs2001
7楼2015-09-09 11:59:37
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