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genedemon773

银虫 (初入文坛)

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专业: 生物信息学

[交流] 【求助】哪些软件能把分子对中的相互作用很好的显示出来？

如题
我希望能找到一个软件能把PDB中的大分子复合物或者自己做分子对接的结果中，两个分子之间形成氢键和离子键的情况清楚地自动识别并且显示出来

目前用的VMD似乎不能很好的实现这一点
不知道pymol行不？请用过的各位战友指教一下
或者推荐一下其他软件
谢谢

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小猪吃小鱼

1楼 2008-08-01 12:05:18

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genedemon773

银虫 (初入文坛)

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引用回帖:

Originally posted by genedemon773 at 2008-8-8 20:30:

请问足下的意思是，pymol也不能通过指令自主识别出分子间氢键和离子键，然后显示出来？
我是说，如果pymol需要我自己指定哪些原子之间形成氢键并且自己手动标示出来，那就不是我本愿了

[ Last edited ...

也请用过pymol的虫友指教一下，谢谢