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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 求助：GO/KEGG注释和pathway enrichment analysis有必要同时做么
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alieen_1118

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助：GO/KEGG注释和pathway enrichment analysis有必要同时做么

各位生物学的专家，小的不是生物学专业，最近通过实验，获得植物对外界环境因子有响应的差异蛋白70个。因为我是个门外汉，我想请教一下，如果我已经送去做了GO和KEGG注释，还有必要再做pathway enrichment analysis么？这两者对差异蛋白的解释有重叠不？
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1楼 2015-07-01 14:28:42
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HYZ221314

至尊木虫 (职业作家)

优秀版主
很多文章都这么做，所以不用担心吧

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青山不断，绿水长流
2楼2015-07-01 14:50:39
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alieen_1118

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by HYZ221314 at 2015-07-01 14:50:39
很多文章都这么做，所以不用担心吧

我还想请教一个问题哈：用david做通路富集分析的时候，有两列值，一列是p value，一列是Benjamini，这个Benjamini的是Benjamini校正后的p值不？发文章的时候应该用哪个值更严谨啊？
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3楼2015-07-15 16:54:18
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HYZ221314

至尊木虫 (职业作家)

优秀版主
引用回帖:
3楼: Originally posted by alieen_1118 at 2015-07-15 16:54:18
我还想请教一个问题哈：用david做通路富集分析的时候，有两列值，一列是p value，一列是Benjamini，这个Benjamini的是Benjamini校正后的p值不？发文章的时候应该用哪个值更严谨啊？...

我见过p值的，
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青山不断，绿水长流
4楼2015-07-15 18:14:11
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Ashleylyj

禁虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
5楼2015-07-20 16:26:49
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HYZ221314

至尊木虫 (职业作家)

优秀版主
引用回帖:
5楼: Originally posted by Ashleylyj at 2015-07-20 16:26:49
您好，请问您有关于建全基因库的文章吗，我最近在研究建全基因库，准备测序，也遇到KEGG,SWISSPROT,GO等应该选哪个的问题，请问能指导一下吗？...

有吧，但是我不知道
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青山不断，绿水长流
6楼2015-07-20 17:34:59
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kuileiwawa

金虫 (小有名气)
你好！我也在学习GO功能分析和KEGG通路分析，请问可以加个QQ讨论下吗？谢谢!
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把小木虫发展壮大！！！
7楼2016-05-09 15:45:44
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kuileiwawa

金虫 (小有名气)
请问你做的GO和KEGG注释怎么样了？他们帮你分析吗？急求

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把小木虫发展壮大！！！
8楼2016-05-16 10:17:28
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