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alieen_1118

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助:GO/KEGG注释和pathway enrichment analysis有必要同时做么

各位生物学的专家,小的不是生物学专业,最近通过实验,获得植物对外界环境因子有响应的差异蛋白70个。因为我是个门外汉,我想请教一下,如果我已经送去做了GO和KEGG注释,还有必要再做pathway enrichment analysis么?这两者对差异蛋白的解释有重叠不?
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HYZ221314

至尊木虫 (职业作家)

优秀版主

很多文章都这么做,所以不用担心吧

[ 发自小木虫客户端 ]
青山不断,绿水长流
2楼2015-07-01 14:50:39
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alieen_1118

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by HYZ221314 at 2015-07-01 14:50:39
很多文章都这么做,所以不用担心吧

我还想请教一个问题哈:用david做通路富集分析的时候,有两列值,一列是p value,一列是Benjamini,这个Benjamini的是Benjamini校正后的p值不?发文章的时候应该用哪个值更严谨啊?
3楼2015-07-15 16:54:18
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HYZ221314

至尊木虫 (职业作家)

优秀版主

引用回帖:
3楼: Originally posted by alieen_1118 at 2015-07-15 16:54:18
我还想请教一个问题哈:用david做通路富集分析的时候,有两列值,一列是p value,一列是Benjamini,这个Benjamini的是Benjamini校正后的p值不?发文章的时候应该用哪个值更严谨啊?...

我见过p值的,
青山不断,绿水长流
4楼2015-07-15 18:14:11
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Ashleylyj

禁虫 (初入文坛)

本帖内容被屏蔽

5楼2015-07-20 16:26:49
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HYZ221314

至尊木虫 (职业作家)

优秀版主

引用回帖:
5楼: Originally posted by Ashleylyj at 2015-07-20 16:26:49
您好,请问您有关于建全基因库的文章吗,我最近在研究建全基因库,准备测序,也遇到KEGG,SWISSPROT,GO等应该选哪个的问题,请问能指导一下吗?...

有吧,但是我不知道
青山不断,绿水长流
6楼2015-07-20 17:34:59
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kuileiwawa

金虫 (小有名气)

你好!我也在学习GO功能分析和KEGG通路分析,请问可以加个QQ讨论下吗?谢谢!
把小木虫发展壮大!!!
7楼2016-05-09 15:45:44
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kuileiwawa

金虫 (小有名气)

请问你做的GO和KEGG注释怎么样了?他们帮你分析吗?急求

发自小木虫IOS客户端
把小木虫发展壮大!!!
8楼2016-05-16 10:17:28
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