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ct_kaoyan金虫 (小有名气)
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[交流]
QST2方法找到过渡态后IRC计算出现l202错误
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RT，请教高手，如何解决问题，万分感谢！ 过渡态是用QST2方法找到的，然后用TS方法优化了QST2找到的过渡态，可以得到唯一虚频，然后再用TS计算得到的过渡态（用gview查看与QST2找到的过渡态结构一样，能量一样）计算IRC找产物和反应物。 QST2找过渡态的基组与方法为： #p b3lyp/6-31g* fopt(qst2,,maxcyc=150) iop(5/13=1) iop(2/16=1) iop(1/11=1) TS优化方法与基组： #p b3lyp/6-31g* fopt(ts,z-matrix,maxcyc=50) iop(5/13=1) iop(2/16=1) freq iop(1/11=1) IRC-fts计算输入文件如下： #p b3lyp/6-31g* irc=(maxpoints=50,rcfc,forward,internal) iop(2/16=1) iop(5/13=1) geom=check guess=check Untitled I Draw Styles-f1ts2 0 1 ~ ~ ~ IRC输出文件的最后几行如下： 31 H 0.000000 32 H 0.000000 0.000000 33 H 0.000000 0.000000 0.000000 Small interatomic distances encountered: 2 1 3 1 3 2 4 1 4 2 4 3 5 1 5 2 5 3 5 4 6 1 6 2 6 3 6 4 6 5 7 1 7 2 7 3 7 4 7 5 Problem with the distance matrix. Error termination via Lnk1e in /home/rwshi/soft/g03/l202.exe at Mon Jun 29 05:54:31 2015. Job cpu time: 0 days 5 hours 40 minutes 11.9 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 153 Int= 0 D2E= 0 Chk= 28 Scr= 2 35419,2 Bot [ Last edited by ct_kaoyan on 2015-7-1 at 17:19 ] |
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ct_kaoyan
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2楼2015-06-30 11:06:46
beefly
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谢谢你的建议，下面是最后一步的坐标，可以看出3号碳原子的Y坐标出现异常，是用星号表示的，gview没法显示结构，请问怎么解决这个问题了？ Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J ------------------------------------------------------------------------ 1 1 C 0 5.238823 0.438130 -0.116319 2 2 C 0 5.035136 -0.951357 0.620244 3 3 C 0 3.780851 *********** 1.596051 4 4 C 0 2.814175 -0.502438 1.767319 5 5 C 0 2.966782 0.944417 1.060862 6 6 C 0 4.220649 1.386053 0.147375 7 7 N 0 1.372179 -0.846187 2.284808 8 8 C 0 0.842129 0.415444 2.037471 9 9 C 0 1.522117 1.800651 1.678391 10 10 C 0 0.707451 -1.982155 1.823121 11 11 C 0 -0.742270 -2.008599 1.595519 12 12 C 0 -1.408730 -0.794506 1.734006 13 13 C 0 -0.520675 0.346235 1.816865 14 14 O 0 0.763312 2.580430 -0.048940 15 15 C 0 -2.737925 -0.154444 1.722602 16 16 C 0 -2.479990 1.308359 1.710443 17 17 N 0 -1.107791 1.559119 1.804029 18 18 C 0 -4.111902 -0.618518 1.815910 19 19 C 0 -5.168533 0.345767 1.903303 20 20 C 0 -4.878766 1.767102 1.869175 21 21 C 0 -3.544253 2.262634 1.759184 22 22 H 0 6.224454 0.805132 -0.915509 23 23 H 0 5.856747 -1.644553 0.408640 24 24 H 0 3.590293 -2.595137 2.161902 25 25 H 0 4.398083 2.481576 -0.400283 26 26 H 0 1.273728 -2.907431 1.636708 27 27 H 0 -1.222647 -2.989228 1.189731 28 28 H 0 -0.328120 2.380053 1.413437 29 29 H 0 -4.352281 -1.711350 1.870470 30 30 H 0 -6.239101 0.012913 2.038610 31 31 H 0 -5.726367 2.499518 1.965169 32 32 H 0 -3.313979 3.355448 1.772589 33 33 H 0 3.065183 3.615389 3.461502 |
7楼2015-07-01 16:38:24
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