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ct_kaoyan

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[交流] QST2方法找到过渡态后IRC计算出现l202错误

RT，请教高手，如何解决问题，万分感谢！
过渡态是用QST2方法找到的，然后用TS方法优化了QST2找到的过渡态，可以得到唯一虚频，然后再用TS计算得到的过渡态（用gview查看与QST2找到的过渡态结构一样，能量一样）计算IRC找产物和反应物。
QST2找过渡态的基组与方法为：
#p b3lyp/6-31g* fopt(qst2,,maxcyc=150) iop(5/13=1) iop(2/16=1) iop(1/11=1)
TS优化方法与基组：
#p b3lyp/6-31g* fopt(ts,z-matrix,maxcyc=50) iop(5/13=1) iop(2/16=1) freq iop(1/11=1)

IRC-fts计算输入文件如下：
#p b3lyp/6-31g* irc=(maxpoints=50,rcfc,forward,internal) iop(2/16=1) iop(5/13=1) geom=check guess=check

Untitled I Draw Styles-f1ts2

0 1
~
~
~

IRC输出文件的最后几行如下：
31  H 0.000000
32  H 0.000000 0.000000
33  H 0.000000 0.000000 0.000000
Small interatomic distances encountered:
   2 1

   3 1

   3 2

   4 1

   4 2

   4 3

   5 1

   5 2

   5 3

   5 4

   6 1

   6 2

   6 3

   6 4

   6 5

   7 1

   7 2

   7 3

   7 4

   7 5
Problem with the distance matrix.
Error termination via Lnk1e in /home/rwshi/soft/g03/l202.exe at Mon Jun 29 05:54:31 2015.
Job cpu time:  0 days  5 hours 40 minutes 11.9 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF= 153 Int=    0 D2E=    0 Chk=    28 Scr=    2
                                                                                             35419,2    Bot

[ Last edited by ct_kaoyan on 2015-7-1 at 17:19 ]

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1楼2015-06-30 10:32:26

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ct_kaoyan

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ct_kaoyan: 回帖置顶 2015-06-30 11:07:12

输入文件如下：
#p b3lyp/6-31g* irc=(maxpoints=50,rcfc,forward,internal) iop(2/16=1) iop(5/13=1) geom=check guess=check

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2楼2015-06-30 11:06:46

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beefly

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
ct_kaoyan: 金币+4, 谢谢！ 2015-07-03 14:56:42

Problem with the distance matrix.

可能是某些原子距离太近了。把最后一步的结构画出来，也许能发现出错的键长

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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地

3楼2015-06-30 19:57:16

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dmbb

★
ct_kaoyan(金币+1): 谢谢参与

4楼2015-07-01 16:30:21

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ylheping

★
ct_kaoyan(金币+1): 谢谢参与

5楼2015-07-01 16:35:50

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neu234

★
ct_kaoyan(金币+1): 谢谢参与

6楼2015-07-01 16:38:18

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ct_kaoyan

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引用回帖:

3楼: Originally posted by beefly at 2015-06-30 19:57:16
Problem with the distance matrix.

可能是某些原子距离太近了。把最后一步的结构画出来，也许能发现出错的键长

谢谢你的建议，下面是最后一步的坐标，可以看出3号碳原子的Y坐标出现异常，是用星号表示的，gview没法显示结构，请问怎么解决这个问题了？
Atom  N1    Length/X    N2 Alpha/Y    N3    Beta/Z    J
------------------------------------------------------------------------
1 1  C    0 5.238823       0.438130       -0.116319
2 2  C    0 5.035136       -0.951357       0.620244
3 3  C    0 3.780851    ***********       1.596051
4 4  C    0 2.814175       -0.502438       1.767319
5 5  C    0 2.966782       0.944417       1.060862
6 6  C    0 4.220649       1.386053       0.147375
7 7  N    0 1.372179       -0.846187       2.284808
8 8  C    0 0.842129       0.415444       2.037471
9 9  C    0 1.522117       1.800651       1.678391
  10  10  C    0 0.707451       -1.982155       1.823121
  11  11  C    0  -0.742270       -2.008599       1.595519
  12  12  C    0  -1.408730       -0.794506       1.734006
  13  13  C    0  -0.520675       0.346235       1.816865
  14  14  O    0 0.763312       2.580430       -0.048940
  15  15  C    0  -2.737925       -0.154444       1.722602
  16  16  C    0  -2.479990       1.308359       1.710443
  17  17  N    0  -1.107791       1.559119       1.804029
  18  18  C    0  -4.111902       -0.618518       1.815910
  19  19  C    0  -5.168533       0.345767       1.903303
  20  20  C    0  -4.878766       1.767102       1.869175
  21  21  C    0  -3.544253       2.262634       1.759184
  22  22  H    0 6.224454       0.805132       -0.915509
  23  23  H    0 5.856747       -1.644553       0.408640
  24  24  H    0 3.590293       -2.595137       2.161902
  25  25  H    0 4.398083       2.481576       -0.400283
  26  26  H    0 1.273728       -2.907431       1.636708
  27  27  H    0  -1.222647       -2.989228       1.189731
  28  28  H    0  -0.328120       2.380053       1.413437
  29  29  H    0  -4.352281       -1.711350       1.870470
  30  30  H    0  -6.239101       0.012913       2.038610
  31  31  H    0  -5.726367       2.499518       1.965169
  32  32  H    0  -3.313979       3.355448       1.772589
  33  33  H    0 3.065183       3.615389       3.461502

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7楼2015-07-01 16:38:24

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