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zy0340907

木虫 (正式写手)

[求助] 求精修晶体和回答编辑审稿意见 已有3人参与

本人投国内一杂志,审稿意见回来了,关于晶体方面的问题,不会弄,请大神们帮忙,晶体方面的审稿意见如下:
1.        单胞中存在一个特大的孔洞(523Å3),中心位于(0.500 0.600 0.000),应给予合理的解释或讨论。
2.        摘要部分给出的分子式[Co2L2Cl2]∙[Co2L2Cl(H2O)]ClO4∙10H2O和check cif给出的分子式2(C18 H16 Cl Co N5 O2), C36 H32 Cl不一致。同时根据作者提供的cif文件并没有发现配合物中有水分子。溶剂分子的个数存在问题。无序分布的占有率合理吗?
3.        在Fig. 1中分子式[CoLCl]∙[CoLCl(H2O)]-1/2不合理 ,而根据你提供的Cif和check cif 中的结构游离在配合物中的是否是ClO4ˉ?望能精修。
4.        在3RESULTS AND DISCUSSION中coordinated by one water oxygen atom [O(5)] (or one chloride ion Cl(2))究竟是O还是Cl?同时在配合物中根据作者的描述有ClO4ˉ存在,这样在整个配合物中电荷不平衡。
5.        在Fig. 2中氢键过于混乱,看不清。
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  • 附件 1 : 待精修晶体.rar
  • 2015-06-22 00:02:18, 1.45 M

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xwnail2003

禁虫 (著名写手)

感谢参与,应助指数 +1
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2楼2015-06-22 07:42:13
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zy0340907

木虫 (正式写手)

楼上的大神没有精修好啊
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3楼2015-06-22 10:07:54
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匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信


感谢参与,应助指数 +1
本帖仅楼主可见
4楼2015-06-22 10:23:52
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
zy0340907: 金币+100, ★★★很有帮助 2015-06-22 15:29:55
数据已经解析好,详见附件。你之前解的结构里有一些原子定错了,导致电荷不平。客体水上的氢没加上,所以squeeze掉了。squeeze掉的溶剂包括一个无序的甲醇分子和四个水分子。
Bond precision:        C-C = 0.0056 A        Wavelength=0.71073
Cell:        a=13.3706(12)        b=14.1406(13)        c=14.1754(13)
alpha=77.488(1)        beta=75.624(1)        gamma=62.574(1)
Temperature:        293 K               
Calculated        Reported
Volume        2288.0(4)        2288.0(4)
Space group        P -1        P-1
Hall group        -P 1        ?
Moiety formula        C18 H16 Cl Co N5 O2, C18 H15 Co N5 O2.38, 0.622(O)        ?
Sum formula        C36 H31 Cl Co2 N10 O5        C36 H31 Cl Co2 N10 O5
Mr        837.02        837.02
Dx,g cm-3        1.215        1.215
Z        2        2
Mu (mm-1)        0.830        0.830
F000        856.0        856.0
F000'        857.95       
h,k,lmax        15,16,16        15,16,16
Nref        8048        7973
Tmin,Tmax        0.833,0.861        0.839,0.865
Tmin'        0.833       
Correction method= # Reported T Limits: Tmin=0.839 Tmax=0.865 AbsCorr = MULTI-SCAN       
Data completeness= 0.991        Theta(max)= 25.000
R(reflections)= 0.0490( 6881)        wR2(reflections)= 0.1728( 7973)
S = 1.146        Npar= 497
The following ALERTS were generated. Each ALERT has the format
       test-name_ALERT_alert-type_alert-level.
Click on the hyperlinks for more details of the test.
Alert level B
PLAT214_ALERT_2_B Atom O5A     (Anion/Solvent) ADP max/min Ratio          5.6 oblate
Alert level C
PLAT094_ALERT_2_C Ratio of Maximum / Minimum Residual Density ....       3.40 Report
PLAT220_ALERT_2_C Large Non-Solvent  O     Ueq(max)/Ueq(min) Range        3.9 Ratio
PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor        N2     -   H2A    ..     Please Check
PLAT430_ALERT_2_C Short Inter D...A Contact  O2     ..  O5B     ..       2.89 Ang.

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  • 2015-06-22 10:44:17, 346.93 K
5楼2015-06-22 10:44:20
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zy0340907

木虫 (正式写手)

内容已删除
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6楼2015-06-22 15:28:42
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zy0340907

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lich666 at 2015-06-22 10:23:52
占有率修的不对,你这个里面都用什么原料的,负离子好像有点问题。

负离子是氯离子,也可能有高氯酸根(以前叫人帮忙解析的,但不确定)
永远支持小木虫!!!
7楼2015-06-22 15:36:44
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