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swordzj858至尊木虫 (著名写手)
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[交流]
【求助】Autodock4中进行RUN-AutoGrid时出现问题（5金币）
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各位高手，我在用Windows版的autodock4做对接时，一直进行到生成*.gpf文件时都比较正常，打开*.gpf文件也没发现问题。但是当我进行RUN-AutoGrid出现如下错误： Running: autogrid4 -p M:\My Project\1y6b.gpf [Error 2] 请教高位高手是什么问题？不胜感激。 附：1y6b.gpf文件 npts 40 40 40 # num.grid points in xyz gridfld 1Y6B_KeyH.maps.fld # grid_data_file spacing 0.375 # spacing(A) receptor_types A C HD N OA SA # receptor atom types ligand_types A NA C S OA # ligand atom types receptor 1Y6B_KeyH.pdbqt # macromolecule gridcenter -0.047 30.207 16.857 # xyz-coordinates or auto smooth 0.5 # store minimum energy w/in rad(A) map 1Y6B_KeyH.A.map # atom-specific affinity map map 1Y6B_KeyH.NA.map # atom-specific affinity map map 1Y6B_KeyH.C.map # atom-specific affinity map map 1Y6B_KeyH.S.map # atom-specific affinity map map 1Y6B_KeyH.OA.map # atom-specific affinity map elecmap 1Y6B_KeyH.e.map # electrostatic potential map dsolvmap 1Y6B_KeyH.d.map # desolvation potential map dielectric -0.1465 # <0, AD4 distance-dep.diel;>0, constant [ Last edited by swordzj858 on 2008-7-28 at 18:55 ] |
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3楼2008-07-29 10:05:25
2楼2008-07-28 21:04:39
yujia5038
铁杆木虫 (小有名气)
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4楼2009-06-30 14:03:24
