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zhaoxvwa

铁虫 (初入文坛)

[交流] 怎么识别转座子

我有一些菌的测序数据,已进行组装并可以基因预测,想要找到这些菌里有哪些转座子,请问该怎么做。
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RuyangHan

金虫 (小有名气)

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zhaoxvwa: 金币+1 2015-07-01 09:49:59
有很多网站都可以预测转座子和其他插入序列,下面是其中一个,不好用的话,可以找其他。
https://www-is.biotoul.fr//
2楼2015-06-21 12:50:15
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zhaoxvwa

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by RuyangHan at 2015-06-21 12:50:15
有很多网站都可以预测转座子和其他插入序列,下面是其中一个,不好用的话,可以找其他。
https://www-is.biotoul.fr//

好的,谢谢,我看看这个。有没有转座子的数据库,我可以直接把我的序列比到数据库,就可以知道我的序列里面有哪个转座子了?
3楼2015-06-24 15:04:44
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霹雳66帕拉

新虫 (小有名气)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhaoxvwa at 2015-06-24 15:04:44
好的,谢谢,我看看这个。有没有转座子的数据库,我可以直接把我的序列比到数据库,就可以知道我的序列里面有哪个转座子了?...

大佬知道用什么网站做转座子的预测的吗
4楼2019-08-13 15:10:38
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