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stickforver

银虫 (小有名气)

[求助] 利用R语言对来自GEO数据库的RNA-seq数据进行差异表达基因分析

各位虫友,大家好!本人初次接触生物信息学,很多问题不懂,在此向各位请教:
  1,我在进行GEO数据库检索时发现,GEO数据库里有很多文件,请问要进行差异基因表达要下载哪个文件。如检索http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE58514
  2,将所需数据从GEO数据库下载之后,如何将数据导入R语言中?
  3,采用R语言进行差异基因表达分析时需要用到哪个软件包?
在此先谢过大家。因为本人现在完全理不清思路,因此如果各位的答案能尽可能详细点的话,我会非常感谢!谢谢!
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Neversaynever.
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銮浔4

新虫 (初入文坛)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-04 16:46:33
楼主现在这问题解决了么,研一新生刚入门,望指点如上问题,谢谢
2楼2016-10-04 16:31:32
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昆虫霸霸

铜虫 (小有名气)

同求,我只知道需要下载原始数据“GSE58514_RAW.tar”,然后如何用R进行,也在学习中
实验加油!
3楼2019-05-10 14:19:17
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