24小时热门版块排行榜

返回列表

lingogo

金虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 67.7
散金: 300
红花: 1
帖子: 56
在线: 78.3小时
虫号: 1813952
注册: 2012-05-13
专业: 化学计量学与化学信息学

[求助] mmgbsa求助，ELE项为0

我在算一个蛋白质和小分子配体的结合能，用amber的mm_pbsa.pl,输入文件如下，为什么算出来的结果△ele  项为0？
@GENERAL
VERBOSE             0
PARALLEL             0
#
PREFIX             wat
PATH                ./
START                1
STOP                100
OFFSET             1
#
COMPLEX             1
RECEPTOR             1
LIGAND             1
#
COMPT                ./com.prmtop
RECPT                ./pro.prmtop
LIGPT                ./lig.prmtop
#
GC                   0
AS                   0
DC                   0
#
MM                   1
GB                   1
PB                   0
MS                   1
#
NM                   0
#
@PB
PROC                2
REFE                0
INDI                1.0
EXDI                80
SCALE                2
LINIT                1000
PRBRAD             1.4
ISTRNG             0.0
RADIOPT             1
INP                2
#
SURFTEN             0.04356
SURFOFF             -1.008
#
IVCAP                0
CUTCAP             -1.0
XCAP                0.0
YCAP                0.0
ZCAP                0.0
#
@MM
DIELC                1.0
#
@GB
IGB                5
GBSA                1
SALTCON             0.00
EXTDIEL             80
INTDIEL             1.0
#
SURFTEN             0.0072
SURFOFF             0.00
#
@MS
PROBE                0.0
#

回复此楼