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[求助]
mmgbsa求助，ELE项为0
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我在算一个蛋白质和小分子配体的结合能，用amber的mm_pbsa.pl,输入文件如下，为什么算出来的结果△ele 项为0？ @GENERAL VERBOSE 0 PARALLEL 0 # PREFIX wat PATH ./ START 1 STOP 100 OFFSET 1 # COMPLEX 1 RECEPTOR 1 LIGAND 1 # COMPT ./com.prmtop RECPT ./pro.prmtop LIGPT ./lig.prmtop # GC 0 AS 0 DC 0 # MM 1 GB 1 PB 0 MS 1 # NM 0 # @PB PROC 2 REFE 0 INDI 1.0 EXDI 80 SCALE 2 LINIT 1000 PRBRAD 1.4 ISTRNG 0.0 RADIOPT 1 INP 2 # SURFTEN 0.04356 SURFOFF -1.008 # IVCAP 0 CUTCAP -1.0 XCAP 0.0 YCAP 0.0 ZCAP 0.0 # @MM DIELC 1.0 # @GB IGB 5 GBSA 1 SALTCON 0.00 EXTDIEL 80 INTDIEL 1.0 # SURFTEN 0.0072 SURFOFF 0.00 # @MS PROBE 0.0 # |
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2楼2018-04-09 11:26:00
