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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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lingogo

金虫 (小有名气)

[求助] mmgbsa求助,ELE项为0

我在算一个蛋白质和小分子配体的结合能,用amber的mm_pbsa.pl,输入文件如下,为什么算出来的结果△ele  项为0?
@GENERAL
VERBOSE               0
PARALLEL              0
#
PREFIX                wat
PATH                  ./
START                 1
STOP                  100
OFFSET                1
#
COMPLEX               1
RECEPTOR              1
LIGAND                1
#
COMPT                 ./com.prmtop
RECPT                 ./pro.prmtop
LIGPT                 ./lig.prmtop
#
GC                    0
AS                    0
DC                    0
#
MM                    1
GB                    1
PB                    0
MS                    1
#
NM                    0
#
@PB
PROC                  2
REFE                  0
INDI                  1.0
EXDI                  80
SCALE                 2
LINIT                 1000
PRBRAD                1.4
ISTRNG                0.0
RADIOPT               1
INP                   2
#
SURFTEN               0.04356
SURFOFF               -1.008
#
IVCAP                 0
CUTCAP                -1.0
XCAP                  0.0
YCAP                  0.0
ZCAP                  0.0
#
@MM
DIELC                 1.0
#
@GB
IGB                   5
GBSA                  1
SALTCON               0.00
EXTDIEL               80
INTDIEL               1.0
#
SURFTEN               0.0072
SURFOFF               0.00
#
@MS
PROBE                 0.0
#
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叮叮咣当

新虫 (初入文坛)

2楼2018-04-09 11:26:00
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