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wzp9012

铁虫 (著名写手)

[求助] 急求呀，基因测序的两个ab1文件如何拼接成一个碱基与峰对因的文件 已有2人参与

求助呀，各位前辈，小弟快答辩了，老师建议附上突变基因的基因测序的原始文件，一段基因测序的两个ab1文件如何拼接成一个碱基与峰对因的文件，我基因总长1152，但两个文件都是1000 多，而且和最终的基因序列都不对应，该怎么弄
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1楼 2015-05-23 21:44:44
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
要拼也是拼seq格式的序列文件，ab1文件为什么要拼在一起？这两个文件一个测的是正向链，一个测的是反向链，峰图怎么拼到一起？
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2楼2015-05-24 11:29:18
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wjasaa

金虫 (初入文坛)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-05-26 23:03:47
用DNASTAR里的一个软件叫seqman，可以实现，可以在论坛上找到这个软件的破解版！
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WWW.ABMGOOD.COM
3楼2015-05-24 11:37:19
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wzp9012

铁虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-05-24 11:29:18
要拼也是拼seq格式的序列文件，ab1文件为什么要拼在一起？这两个文件一个测的是正向链，一个测的是反向链，峰图怎么拼到一起？

我也放了seq里的序列，感觉 老师要求测序原始文件，应该是测的证明吧。突变点测序对应的碱基这样

[ 发自小木虫客户端 ]
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4楼2015-05-24 14:26:06
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
wzp9012: 金币+5 2015-05-24 16:29:27
引用回帖:
4楼: Originally posted by wzp9012 at 2015-05-24 14:26:06
我也放了seq里的序列，感觉 老师要求测序原始文件，应该是测的证明吧。突变点测序对应的碱基这样
...

那就单把突变点处的截个图，比较下正常和突变体测序结果在该位点的差异。
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5楼2015-05-24 15:45:28
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wzp9012

铁虫 (著名写手)
内容已删除
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6楼2015-05-24 16:29:22
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wzp9012

铁虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by stone2239 at 2015-05-24 15:45:28
那就单把突变点处的截个图，比较下正常和突变体测序结果在该位点的差异。...

我基因1152碱基，但测序的两个ab1，每个都1000左右，不知怎么对应，请您指点。seq文件里的序列比对后找得到，ab1 的对应序号找不到
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7楼2015-05-24 16:31:41
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by wzp9012 at 2015-05-24 16:31:41
我基因1152碱基，但测序的两个ab1，每个都1000左右，不知怎么对应，请您指点。seq文件里的序列比对后找得到，ab1 的对应序号找不到...

用软件拼接后，你可以看到每个测序文件中碱基在整个序列中的对应位置。
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8楼2015-05-24 17:40:51
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a13515517892

木虫 (小有名气)
商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
引用回帖:
4楼: Originally posted by wzp9012 at 2015-05-24 14:26:06
我也放了seq里的序列，感觉 老师要求测序原始文件，应该是测的证明吧。突变点测序对应的碱基这样
...

你可以把你的拼接文件做成PDF格式的贴到文章中
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9楼2015-05-25 13:00:49
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a13515517892

木虫 (小有名气)
商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
引用回帖:
6楼: Originally posted by wzp9012 at 2015-05-24 16:29:22
恩，我也试过这个，但不知为什么序列和提供的seq序列以及我野生酶的序列不同...

测序结果出来和SEQ不一样，说明结果不对呗
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10楼2015-05-25 13:01:23
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