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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » "单倍型"，什么是单倍型。
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两点水516

铜虫 (初入文坛)

[求助] "单倍型"，什么是单倍型。 已有1人参与

对分子生物不太了解，麻烦大家帮忙。
“单倍型：一条染色体上两个或两个以上的多态性位点状态（等位基因）的组合叫作染色体单倍型。”
单倍型如何理解，为什么是两个或两个以上的多态性位点状态，如果是一个多态性位点状态那有是什么？如果某段DNA上有3个SNPs，理论上存在多少种单倍型？
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1楼 2015-05-20 10:42:50
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rhapsody007

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
两点水516(晞朔代发): 金币+2, 可能还需要改进一下，用染色体1、2、3会有歧义。意思是一条染色体上的单倍型1、2和3 2015-05-20 15:34:11
晞朔: MolEPI+1 2015-05-20 15:36:45
两点水516: 金币+3, ★★★很有帮助, 解决了部分问题，谢谢。 2015-05-22 09:25:32
让我瞬间想到了 我当时上学那会的迷茫如同楼主一样。
那会我也是做SNP的，被各种名词搞得七荤八素，现已毕业三年，想起当年的状态，心中竟还有一丝激动。
我已不做科研三年了，所以我对问题的认识，还停留在三年前，不知道可否帮助楼主。如有错误或者不严谨的地方，就全当我胡说。
举例说明吧：
首先，定义是一条染色体上至少存在2个等位基因位点，这样的等位基因位点组合叫做单体型。如：
染色体1：******T******G******
染色体2：******C******A******
染色体3：******T******A******
那么，TG,CA,TA分别是染色体1、2、3的单倍型。

如果只有一个多态性位点，即
染色体1：******T******
染色体2：******C******
染色体3：******T****** 这样就没法构成单倍型了，只是一个等位基因位点而已。
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吉恩特磁珠
2楼2015-05-20 11:44:12
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两点水516

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by rhapsody007 at 2015-05-20 11:44:12
让我瞬间想到了 我当时上学那会的迷茫如同楼主一样。
那会我也是做SNP的，被各种名词搞得七荤八素，现已毕业三年，想起当年的状态，心中竟还有一丝激动。
我已不做科研三年了，所以我对问题的认识，还停留在三年 ...

如过是这样呢，染色体1、2、3的单倍型又是怎样的
染色体1：***A***T******G******
染色体2：***C***C******A******
染色体3：*******T******A******
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3楼2015-05-22 09:31:54
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rhapsody007

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 两点水516 at 2015-05-22 09:31:54
如过是这样呢，染色体1、2、3的单倍型又是怎样的
染色体1：***A***T******G******
染色体2：***C***C******A******
染色体3：*******T******A******...

按照你说的这样，染色体1的单倍型就是ATG，2是CCA，3是*TA，但是3上的这个*，应该不是A就是C
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吉恩特磁珠
4楼2015-05-22 10:00:48
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Z.Ada

铁虫 (小有名气)
请问多态性位点是不是不一样的核苷酸？研究单倍型可以说明什么问题？我最近才接触这方面知识，请多指教！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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5楼2015-08-25 19:37:58
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笔尖上的躁动

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by rhapsody007 at 2015-05-20 11:44:12
让我瞬间想到了 我当时上学那会的迷茫如同楼主一样。
那会我也是做SNP的，被各种名词搞得七荤八素，现已毕业三年，想起当年的状态，心中竟还有一丝激动。
我已不做科研三年了，所以我对问题的认识，还停留在三年 ...

师兄/师姐，你好，我最近在做植物种质遗传方面的研究，看到了您回复的帖子，想请教几个问题，关于单倍型，例：30个居群，239个样品，怎么得出来20个单倍型？
这是我看的一篇文献上面的数据，做群体方面研究，单倍型和样品或者群体没有关系么？
比如我做50个样品，用2对引物测出来的话，引物1，测序50个样品，每个样品的这段序列都有突变位点，怎么算？而且还有的研究还需要把两个引物测序的进行拼接？然后再计算单倍型数？这3*5太难了，求解答
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6楼2016-03-08 18:20:26
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