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关于multiwfn里ADCH的一些疑问已有1人参与
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最近刚入量化计算坑,真是大坑。 我在算分子以及激发态的偶极矩,准确来说是键偶极矩。研究思路是高斯计算→得出wfn文件→multiwfn查看ADCH→记录每个原子的电荷分布→乘以键长=键偶极矩(偶极矩定义是正负电中心距离x电荷嘛)。然后问题出现了。 1.中性分子,但原子的正负电荷全加起来并不严格等于0,有时甚至一模一样的化学键电荷都不同(比如CH4里四个氢的电荷分布不一样)。老师说真是保留位数不同没什么影响,这真的没影响吗? 2.一个与正电原子相连的另一原子必须带负电吗?比如NH2F,算出来N和F都是带负电的,这就不知道该怎么分配电荷来计算N-F键的偶极矩了。 请求前辈们指导一下,或者给点解决方案。谢谢了!!!!! |
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yongleli
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【答案】应助回帖
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感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3, 感谢应助 2015-05-16 17:14:15
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1. 不同的电荷功能不同。ESP电荷只是考虑到了分子周围的静电势,对分子内部相互作用的描述不靠谱。ChelpG貌似原理上更优,考虑到了分子内部的静电势分布;但是结果跟ESP差不多。NBO电荷只是给有机化学家看的,电荷数值偏大。AIM常常给出超出正常范围的电荷,比如氧有时有绝对值大于1.0电荷。而且,以上电荷都主要用于讨论分子间相互作用。 2. 相同种类的原子附近,在分子中的电子云分布不同,坐标不同,得到的电荷就会有差别。只有做进一步的约束计算才能得到具有对称性的电荷。 请参考MacKerel的主页,和RED网页: http://q4md-forcefieldtools.org/RED/ 3. 研究分子内局域性质,计算电荷不是个好办法。因为电荷不是物理可测量,定义具有随意性。建议多查文献多看看别人是怎么做的。 |
2楼2015-05-16 08:36:40
yongleli
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【答案】应助回帖
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gmy1990: 金币+3, 谢谢交流 2015-05-16 17:14:26
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AIM文献推荐: http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/jp001062e http://www.uwyo.edu/kubelka-chem/population_analysis.pdf http://www.lct.jussieu.fr/manuels/Gaussian98/00000415.htm (Gaussian成员中,开发AIM的人2000年左右离开了Gaussian公司,导致AIM功能不全。但是对于简单体系,仍然可以做AIM分析。) https://notendur.hi.is//~egillsk ... der_pres_150206.pdf 还有个ELF(electron localization function)分析也可以试试。 http://www2.cpfs.mpg.de/ELF/index.php http://onlinelibrary.wiley.com/d ... 7610709.ch6/summary |
3楼2015-05-16 08:41:15













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