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liuli124125

铜虫 (初入文坛)

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[交流] 新手测序遇到问题，向各位虫子求助

我在所测得的序列中怎么也找不到下游引物序列，是测序的问题吗还是我的PCR过程出了问题呀。我用的是菌液去测序的，引物是简并引物。问题到底在哪里，我应该怎么去解决呀。向高手们求助了，谢谢。

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1楼 2008-07-13 00:39:39

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xyklmu

至尊木虫 (知名作家)

虫眼看世界

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专业: 发育生物学

有可能是没有测通，所以你找不到另一端的引物。
最好不要用pcr反应产物去测序，虽说现在有不少这样的业务，大多数还是认同克隆测序的。如果用于这次测序的引物是你自己提供的简并引物的话，很有可能是找不到的。
如果你只是找不到扩增引物的序列，但是能找到后面所要扩增的序列的话，那么可能还是因为测序引物离你的扩增片断太近。如果不是这种情况，那么可能是你根本没有将扩增片断成功连入。当然还有一种可能是公司测序送错了结果，把别人的结果送给了你，呵呵。