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oudegeshen

银虫 (小有名气)

[求助] 在DPD Calculation设定Temperature=1.0,为什么呢?那么kBT=1.0意味着kB=1,T=1吗? 已有1人参与

在DPD Calculation设定Temperature=1.0,为什么呢?那么kBT=1.0意味着kB=1,T=1吗?可是KB不是波尔兹曼常数吗,怎么会等于1?温度怎么会等于1?
谢谢!
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oudegeshen

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by chuntao118 at 2015-05-09 13:22:17
我只是给你举个例子,这是在水分子体系下选择的,不同体系有不同的选择,要看你模拟的体系是什么体系。体系变化就会跟着变化。...

非常感谢您的指点。因为这几天我有期末考试,所以未能及时回复您。现在我还有一些疑问,如果您不介意的话还请指教。1.怎样知道我的体系的能量参数呢?2.我模拟时设定T=1.0(default),只是参考文献中别人这么用所以我也这么用了,但是不懂为什么。3.我的体系是药物分子&聚合物分子混合物,以及聚合物A&聚合物B混合物。O(∩_∩)O谢谢!
6楼2015-05-13 09:37:00
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chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
oudegeshen: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-05-09 11:13:46
abinitio: 金币+1, 鼓励交流 2015-05-11 08:30:54
不是这样的,温度在模拟式要无量刚化:模拟温度=模拟体系实际温度*波尔兹曼常数/体系选定的单位能量(e)来确定的,通常我们都是将kBT作为 单位能量了(1),比如实际温度298K,能量参数选为0.155kal/mol最终的模拟温度大约是3.8,因为这里面0.155(kal/mol)/kB=78.2K, 3.8=298/78.2.,个人认为,MD,DPD,MC中的初始温度方法都是一样的。
2楼2015-05-08 21:04:03
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oudegeshen

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chuntao118 at 2015-05-08 21:04:03
不是这样的,温度在模拟式要无量刚化:模拟温度=模拟体系实际温度*波尔兹曼常数/体系选定的单位能量(e)来确定的,通常我们都是将kBT作为 单位能量了(1),比如实际温度298K,能量参数选为0.155kal/mol最终的模拟温 ...

O(∩_∩)O谢谢
模拟温度为什么默认为1.0呢?按你的意思298K时,T应该设定为3.8啊?但是T的范围只能在某一个范围(没记错的话好像是0.1-3.0)。您说能量参数选0.155kal/mol,请问为什么选这个值呢?

再次感!
3楼2015-05-09 11:13:15
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oudegeshen

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chuntao118 at 2015-05-08 21:04:03
不是这样的,温度在模拟式要无量刚化:模拟温度=模拟体系实际温度*波尔兹曼常数/体系选定的单位能量(e)来确定的,通常我们都是将kBT作为 单位能量了(1),比如实际温度298K,能量参数选为0.155kal/mol最终的模拟温 ...

暂时给您5个金币,请您不要介意。
4楼2015-05-09 11:15:11
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