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特殊位置氧原子加氢怎么处理 已有1人参与
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遇到一个晶体结构 中心氧原子的占有率是1/6，要加氢成OH，无法在残余峰中找到氢原子 如果hadd理论加氢，grow之后会跑出六个占有率为1/6的氢原子，非常混乱 请问哪位大侠有这方面加氢的经验，万分感激！ |
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aflymoon: 金币+25, ★★★很有帮助, 谢谢啦，我试一试！ 2015-05-11 20:47:36
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本人初学结构解析，几点心得体会，与钧分享如下： 1，无法在残余峰中找到氢原子，似乎这不太可能，往往角度和距离不合理罢了，用DFIX限制下OH和HA-HB的距离，一般能解决问题。 2，占有率无序的原子加氢，个人觉得最靠谱的方法就是通过wingx找到理论氢的原子坐标（个人觉得，不管用什么方法加氢，其实就是找氢理想的原子坐标），然后修改热振动参数，令人满意的是，通过Cal-OH计算得到的氢原子坐标，往往合理，不报AB类错误。当然，任何一种方法没有绝对的万能，有些氢用此种方法是找不到理论坐标的。 3，还可用Xseed理论加氢，通常此类方法加氢，键长要长些。 上面是我的一点心得体会，很多为什么，本人也不是很清楚，望各位高手雅正，我也可进步，谢谢。  |
2楼2015-05-08 09:35:14
