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northwindy

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 占位为50%的羟基氧怎样加氢?

结构中有个桥连氧原子,根据电荷平衡确定是个羟基氧原子,该氧原子占位50%,理论加氢 HFIX 147 O3 和 HFIX 83 O3 都加不上,Q峰手动加氢后,长完后是一个水分子桥连而不是羟基桥连,将H的占位改成50%也不行,不知怎么弄?恳请各位虫友不吝赐教。
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superliky

木虫 (正式写手)

不如贴数据上来。
这么模糊,都看不懂。
如果数据质量不错,q峰加氢错不了。
2楼2012-09-22 18:31:24
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panperfect

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
northwindy: 金币+2, 有帮助 2012-09-30 11:09:01
lijunjie84: 金币+1, 感谢应助! 2012-10-01 12:57:34
你自己先看能不能确定到底是水还是羟基,光根据电荷平衡似乎不够。这个问题先不说,从你描述来看,那个O应该位于特殊位置(2次轴或者镜面上),这样通过Q峰加上一个H后,由于对称性原因,如果这个H不在特殊位置,就会产生两个H,仅仅想让它合理很简单,你可以限制这个H的占有率使得O:H=1:1,这样即使完整结构后看起来好像O周围有两个H,但是两个氢都是半占有,也就是说是H无序造成的。
3楼2012-09-30 07:12:55
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northwindy

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by panperfect at 2012-09-30 07:12:55
你自己先看能不能确定到底是水还是羟基,光根据电荷平衡似乎不够。这个问题先不说,从你描述来看,那个O应该位于特殊位置(2次轴或者镜面上),这样通过Q峰加上一个H后,由于对称性原因,如果这个H不在特殊位置 ...

非常感谢,那请问怎样限制这个H的占有率使得O:H=1:1?我当时只把根据Q峰加好的H的占有率直接改为10.5,但对称后还是两个H
4楼2012-09-30 11:08:46
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panperfect

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lijunjie84: 金币+1 2012-10-01 12:57:39
northwindy: 金币+8, ★★★很有帮助 2012-10-01 13:06:39
引用回帖:
4楼: Originally posted by northwindy at 2012-09-30 11:08:46
非常感谢,那请问怎样限制这个H的占有率使得O:H=1:1?我当时只把根据Q峰加好的H的占有率直接改为10.5,但对称后还是两个H...

如果在不对称单元里O旁边只有一个H,你的做法就可以,对称性操作之后,看到O周围有两个H,两个H加起来的占有率是1.跟O是一样的。
5楼2012-09-30 22:48:26
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