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minmin_0082003金虫 (正式写手)
莫愁莫愁
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[求助]
NiO 单胞坐标以及NiO(111)面的建立－siesta或者高斯
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没有material statio， 所以求助 高斯或者siesta中NiO单胞 的写法， 以及NiO(111) 的建立方法。 单胞的写法， 以siesta为例， 我时这样写的: (以下坐标优化出来的的lattice vector 是错的，求助正确写法 ) %block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies 0.00000000 0.00000000 0.00000000 1 2.08500000 2.08500000 2.08500000 2 %endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies LatticeConstant 1.0000000 Ang %block LatticeVectors 4.17000 0.00000000 0.00000000 0.00000000 4.170000 0.00000000 0.00000000 0.00000000 4.17000000 %endblock LatticeVectors |
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看起来应该是这样的： %block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies esian 0.000000000 0.000000000 0.000000000 1 0.000000000 2.084199905 2.084199905 1 2.084199905 0.000000000 2.084199905 1 2.084199905 2.084199905 0.000000000 1 2.084199905 2.084199905 2.084199905 2 2.084199905 0.000000000 0.000000000 2 0.000000000 2.084199905 0.000000000 2 0.000000000 0.000000000 2.084199905 2 %endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies 应该是晶格内原子的坐标错了。 我这人比较懒，可以这样： 从MS导出cif（其他途径得到cif也行），然后通过VESTA程序转换为vasp的格式（笛卡尔坐标），之后把坐标拷贝过来按照元素顺序加上编号即可。表面模型也是如此建立，当然借助MS简单的多，可以找个破解版建模使用而已。 |
2楼2015-05-07 14:43:02
minmin_0082003
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非常感谢，我最开始是用这个做的，但是输出文件里总是显示 原子间距离太近.... 这个是我以前的输入坐标 %block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies 0.00000000 0.00000000 0.00000000 1 0.00000000 2.08500000 2.08500000 1 2.08500000 0.00000000 2.08500000 1 2.08500000 2.08500000 0.00000000 1 2.08500000 2.08500000 2.08500000 2 2.08500000 0.00000000 0.00000000 2 0.00000000 2.08000000 0.00000000 2 0.00000000 0.00000000 2.08000000 2 %endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies LatticeConstant 1.0000000 Ang %block LatticeVectors 4.17000 0.00000000 0.00000000 0.00000000 4.170000 0.00000000 0.00000000 0.00000000 4.17000000 %endblock LatticeVectors 电脑全部mac，装不了MS，而且破解版的不敢轻易装，被学校抓到就死翘翘了 |
3楼2015-05-07 15:35:11
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非常感谢，我最开始是用这个做的，但是输出文件里总是显示 原子间距离太近.... 这个是我以前的输入坐标 %block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies 0.00000000 0.00000000 0.00000000 1 0.00000000 2.08500000 2.08500000 1 2.08500000 0.00000000 2.08500000 1 2.08500000 2.08500000 0.00000000 1 2.08500000 2.08500000 2.08500000 2 2.08500000 0.00000000 0.00000000 2 0.00000000 2.08000000 0.00000000 2 0.00000000 0.00000000 2.08000000 2 %endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies LatticeConstant 1.0000000 Ang %block LatticeVectors 4.17000 0.00000000 0.00000000 0.00000000 4.170000 0.00000000 0.00000000 0.00000000 4.17000000 %endblock LatticeVectors 电脑全部mac，装不了MS，而且破解版的不敢轻易装，被学校抓到就死翘翘了 |
4楼2015-05-07 15:35:21
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