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厌氧氨氧化反应器分子生物学鉴定 已有1人参与
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课题组培养了一个厌氧氨氧化反应器，要做微生物种群结构鉴定，把样品寄给公司，他们说他们公司细菌16S测序的引物是： V3-V4区 Nobar_341F（CCTACGGGNGGCWGCAG） Nobar_805R（GACTACHVGGGTATCTAATCC V1-V3区 Nobar_Bac_V1F-27F AGAGTTTGATCMTGGCTCAG Nobar_Bac_V3R2-CAC GTATTACCGCGGCTGCTGGCAC V4-V5区 ---- V3区 ------ V4区 Nobar_515F GTGCCAGCMGCCGCGGTAA Nobar_909R GACTACHVGGGTATCTAATCC 扩增古细菌我们这边采用的是巢式PCR。两轮引物： 第一轮是：340F：CCCTAYGGGGYGCASCAG 1000R：GGCCATGCACYWCYTCTC 第二轮是：349F：GYGCASCAGKCGMGAAW 806R：GGACTACVSGGGTATCTAAT 细菌方面，一般做V3-V4区的比较多，他们认为它有一个比较好的覆盖度，如果客户有根据文献作出选择，以客户的选择为主。 我不太清楚采用V3-V4区能否覆盖里面主要的微生物厌氧氨氧化菌，哪位大神给个建议；如果我采用厌氧氨氧化菌的特征引物amx368f和amx820r，那么反应器内的其他细菌是不是还要用比如通用的引物来扩增 |
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maxiao1222
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