应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 小妹想弱弱的问一句纵轴为RMSD值，横轴为时间的坐标图是利用什么软件做出来的？如下图
51/1返回列表
查看: 3742  |  回复: 18
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

三与七之间

铁虫 (小有名气)

[求助] 小妹想弱弱的问一句纵轴为RMSD值，横轴为时间的坐标图是利用什么软件做出来的？如下图 已有4人参与

我最近在弄我的毕业论文，涉及到了一种图，不知道是利用什么软件做出来的，文献上也没有说的很清楚，这个图与分子动力学模拟有关，请求大神们帮帮我~~~~

小妹想弱弱的问一句纵轴为RMSD值，横轴为时间的坐标图是利用什么软件做出来的？如下图
图片1.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2015-05-05 09:56:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三与七之间

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 三与七之间 at 2015-05-05 10:34:18
我从文献上复制下来这段话：
We calculated the RMSD for all the atoms from the initial
structure that was considered as the central origin to measure the
convergence of the protein system concerned ...

那个图传错了，嘿嘿，是这个。。。
小妹想弱弱的问一句纵轴为RMSD值，横轴为时间的坐标图是利用什么软件做出来的？如下图-1
3.png
赞一下 回复此楼
4楼2015-05-05 10:39:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
三与七之间(月只蓝代发): 金币+2, 感谢指导 2015-05-05 14:09:11
欢迎研究人类遗传学的朋友光临，呵呵。
RMSD是一种统计学上的处理方法，用来描述偏差的大小。计算方法就是将所以有离散点之差，平方，之后再进行平均，然后再开方。因此，并不一定是分子动力学模拟的结果。分子动力学之是找到那些离散的点。RMSD一般写个小程序就可以得到。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2015-05-05 10:15:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三与七之间

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2015-05-05 10:15:29
欢迎研究人类遗传学的朋友光临，呵呵。
RMSD是一种统计学上的处理方法，用来描述偏差的大小。计算方法就是将所以有离散点之差，平方，之后再进行平均，然后再开方。因此，并不一定是分子动力学模拟的结果。分子动力 ...

我从文献上复制下来这段话：
We calculated the RMSD for all the atoms from the initial
structure that was considered as the central origin to measure the
convergence of the protein system concerned (Figure 5).
这的确使用统计软件做出来的么？用SPSS就可以弄出来是不？
小妹想弱弱的问一句纵轴为RMSD值，横轴为时间的坐标图是利用什么软件做出来的？如下图-2
2.png
赞一下 回复此楼
3楼2015-05-05 10:34:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 三与七之间 at 2015-05-05 10:39:40
那个图传错了，嘿嘿，是这个。。。

3.png
...

哦，蛋白质的，这个结果看起来是用分子动力学作出来的结果。
不过，这个图是否是软件自动生成的，我就不得而知了。不过还是建议自己写个程序处理一下再画图
赞一下 回复此楼
5楼2015-05-05 15:06:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +8 ziyangfang 2026-08-25 11/550 2026-09-01 09:51 by zzuzxg
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +6 叶九微 2026-08-26 6/300 2026-08-31 23:54 by yudaoqian88
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-31 21:30 by xiangy672
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中，共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭