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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 引物设计
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金虫 (正式写手)

[求助] 引物设计 已有1人参与

怎么设计质粒构建引物，如何选择内切酶？
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惊叹号

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1楼 2015-05-05 09:37:22
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惊叹号

金虫 (正式写手)
送红花一朵
大家帮我看一下这对引物设计的合不合理
CDS序列
atggccgtca tggcgccccg aaccctcgtc ctgctactct cgggggctct ggccctgacc cagacctggg cgg gctctca ctccatgagg tatttcttca catccgtgtc ccggcccggc cgcggggagc cccgcttcat cgcagtgggc tacgtggacg acacgcagtt cgtgcggttc gacagcgacg ccgcgagcca gaggatggag ccgcgggcgc cgtggataga gcaggagggt ccggagtatt gggacgggga gacacggaaa gtgaaggccc actcacagac tcaccgagtg gacctgggga ccctgcgcgg ctactacaac cagagcgagg ccg gttctc
acaccgtcca gaggatgtat ggctgcgacg tggggtcgga ctggcgcttc ctccgcgggt accaccagta cgcctacgac ggcaaggatt acatcgccct gaaagaggac ctgcgctctt ggaccgcggc ggacatggca gctcagacca ccaagcacaa gtgggaggcg gcccatgtgg cggagcagtt gagagcctac ctggagggca cgtgcgtgga gtggctccgc agatacctgg agaacgggaa ggagacgctg cagcgcacgg acgcccccaa aacgcatatg actcaccacg ctgtctctga ccatgaagcc accctgaggt gctgggccct gagcttctac cctgcggaga tcacactgac ctggcagcgg gatggggagg accagaccca ggacacggag ctcgtggaga ccaggcctgc aggggatgga accttccaga agtgggcggc tgtggtggtg ccttctggac aggagcagag atacacctgc catgtgcagc atgagggttt gcccaagccc ctcaccctga gatgggagccg tcttcccagc ccaccatccc catcgtgggc atcattgctg gcctggttct ctttggagct gtgatcactg gagctgtggt cgctgctgtg atgtggagga ggaagagctc agatagaaaagg agggagctac tctcaggctg caagcagt gacagtgccc agggctctga tgtgtctctc acagcttgta aagtgtga
载体：EGFP-N2
酶切位点：EcoRI,BamHI
引物序列：
F：5`-CG GAA TTC ATG GCC GTC ATG
R:  5`-CG GGA TCC TCA CAC TTT ACA AGC TG
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15楼2015-05-05 21:25:37
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晞朔

金虫 (正式写手)
你可能要具体描述下你要做什么？这个问题，别人都没办法回答，太大了。
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惊叹号
2楼2015-05-05 10:13:53
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nemo88

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
惊叹号: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-05-05 10:31:28
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2015-05-06 13:07:50
本帖内容被屏蔽
3楼2015-05-05 10:27:02
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惊叹号

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by nemo88 at 2015-05-05 10:27:02
质粒构建的 引物跟质粒没有关系  跟你想插入到质粒中的基因片段有关系
具体引物设计看看软件操作说明即可，很简单，不然说也说不清楚
酶切位点先看质粒上的多克隆位点，然后分析自己序列中有没有这些酶切位点，只 ...

哪些情况下设计引物时不需要加酶切位点，是不是那种针对载体的内切酶切出的是平末端？
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4楼2015-05-05 10:31:18
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