| 查看: 1397 | 回复: 2 | ||
zhangmao511铁虫 (小有名气)
|
[求助]
如何将WP_012305643这样的ID，转换成GI号或者gene id啊？谢谢
|
|
想问一下，像这种ID如何转换成类似gene id或者GI号啊？ 我是在NCBI上的在线BLASTP丢了一条蛋白序列，比对之后生成了这样的ID。我想对它们进行GO注释，但是苦于不知道这是什么ID。是不是要下载一个IDMAPPING的映射库文件啊？然后自己写个脚本将对应的ID抽提出来。在哪下载这个ID的映射库文件啊？？谢谢 ref|WP_012305643.1| ref|WP_030008059.1| ref|WP_024545289.1| ref|WP_015132253.1| ref|WP_015180113.1| ref|WP_015191303.1| |
回复此楼» 猜你喜欢
科研人必读：新一代 KRAS G12C 抑制剂 Olomorasib 的研究进展
已经有0人回复
-
BT-11（Omilancor）研究化合物全解析：从分子结构到实验应用要点
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有116人回复
-
富马酸贝达喹啉：二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
-
BT投稿with editor状态快两周了，正常吗
已经有25人回复
-
Silevertinib（BDTX-1535）结构拆解：炔基双环片段为何成为合成瓶颈
已经有0人回复
-
RO4929097 解析：双苯并氮杂䓬骨架与 Notch 通路实验设计要点
已经有0人回复
-
分子量 1157 的 PROTAC 怎么配不析出：SGK3-PROTAC1 的溶解、分装与图谱复核
已经有0人回复
-
logP 6.1 的羧酸怎么配母液：GSK 650394 的溶解窗口与稀释顺序
已经有0人回复
-
从"水不溶"到 71 mg/mL：雷特格韦的 pH 依赖溶解与螯合色谱边界
已经有0人回复
-
133 Ų 的极性表面积，如何决定 TNG462 的母液配制与色谱条件
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 已知gene id如何进行go注释？
已经有5人回复
zhangmao511
铁虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 33
- 红花: 2
- 帖子: 136
- 在线: 29.7小时
- 虫号: 2553312
- 注册: 2013-07-19
- 性别: GG
- 专业: 蛋白质组学
| 我将NCBI的ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/gene/DATA/下的gene2accession.gz和gene2refseq.gz都下载下来了，可是上面的ID在这2哦文件里都在不到，是什么原因啊？这2个库文件更新时间都是今天。但是将WP_012305643放在NCBI上就能查到对应的GI号。这是个怎么回事啊？ |
2楼2015-04-29 22:24:26
zhangmao511
铁虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 33
- 红花: 2
- 帖子: 136
- 在线: 29.7小时
- 虫号: 2553312
- 注册: 2013-07-19
- 性别: GG
- 专业: 蛋白质组学
3楼2015-05-03 12:13:55
