24小时热门版块排行榜    

查看: 1325  |  回复: 2

zhangmao511

铁虫 (小有名气)

[求助] 如何将WP_012305643这样的ID,转换成GI号或者gene id啊?谢谢

想问一下,像这种ID如何转换成类似gene id或者GI号啊?
我是在NCBI上的在线BLASTP丢了一条蛋白序列,比对之后生成了这样的ID。我想对它们进行GO注释,但是苦于不知道这是什么ID。是不是要下载一个IDMAPPING的映射库文件啊?然后自己写个脚本将对应的ID抽提出来。在哪下载这个ID的映射库文件啊??谢谢
ref|WP_012305643.1|
ref|WP_030008059.1|
ref|WP_024545289.1|
ref|WP_015132253.1|
ref|WP_015180113.1|
ref|WP_015191303.1|
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmao511

铁虫 (小有名气)

我将NCBI的ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/gene/DATA/下的gene2accession.gz和gene2refseq.gz都下载下来了,可是上面的ID在这2哦文件里都在不到,是什么原因啊?这2个库文件更新时间都是今天。但是将WP_012305643放在NCBI上就能查到对应的GI号。这是个怎么回事啊?
2楼2015-04-29 22:24:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmao511

铁虫 (小有名气)

自己顶一下
3楼2015-05-03 12:13:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhangmao511 的主题更新
信息提示
请填处理意见