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小悠小嘻

新虫 (小有名气)

[求助] 已知gene id如何进行go注释?

【求助/交流】各位虫友,新人一个,已知gene id怎样利用在线网站找到go功能和go注释,因为基因不多,所以不想下载软件,小菜鸟一个,希望大家能详细的说一下,另外gi是gene id的缩写吗,见笑了,耽误大家时间先道个谢
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举步维艰,但也会选择继续前行
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orochi_hsh

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小悠小嘻: 金币+2, ★★★很有帮助, 我就有2.5个金币,奖励只能为整数,真不好意思啊。。。 2013-08-02 12:58:17
不需要使用软件,网页在线就可以完成
用你的gi号,先做BlastX,再将查到的蛋白做GO功能分析(EBI上有个quick go挺好用)
2楼2013-08-02 10:09:01
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小悠小嘻

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by orochi_hsh at 2013-08-02 10:09:01
不需要使用软件,网页在线就可以完成
用你的gi号,先做BlastX,再将查到的蛋白做GO功能分析(EBI上有个quick go挺好用)

还是想问一下,因为我使用的是华大测序的结果,有很多基因没有gi号该怎么办呢?
举步维艰,但也会选择继续前行
3楼2013-08-02 12:59:45
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orochi_hsh

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 小悠小嘻 at 2013-08-02 12:59:45
还是想问一下,因为我使用的是华大测序的结果,有很多基因没有gi号该怎么办呢?...

BLAST 查一下序列呗~
4楼2013-08-09 14:53:07
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luck_cc

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by orochi_hsh at 2013-08-02 10:09:01
不需要使用软件,网页在线就可以完成
用你的gi号,先做BlastX,再将查到的蛋白做GO功能分析(EBI上有个quick go挺好用)

我也想请教下,不过我的序列有很多,有fasta格式,当然也有gi号,目前也想知道注释,该怎么做呢
认真目标,勇往直前
5楼2013-11-20 16:10:08
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luck_cc

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by orochi_hsh at 2013-08-02 10:09:01
不需要使用软件,网页在线就可以完成
用你的gi号,先做BlastX,再将查到的蛋白做GO功能分析(EBI上有个quick go挺好用)

blast的结果还是一些序列号,我想知道怎么去做go注释呢,请多多指教
认真目标,勇往直前
6楼2013-11-20 16:11:39
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