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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

[交流] 【求助】有关autodock的问题?


Autodock的结果中Binding energy的下面有一项是KI值,这个值的英文的是:Inhibition_constant,单位是pM/nM/uM/mM等,并随binding energy的增大而增大,即排在第一位的KI值最小,请问这个值的含义是什么?


[ Last edited by gwdavid on 2008-7-10 at 12:25 ]
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

自己顶啊,请高手帮忙!
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
2楼2008-07-10 12:19:34
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weishenme

金虫 (小有名气)


suntao1982(金币+1,VIP+0):xiexie
根据结合能计算的结合常数吧,印象里ΔG=-RTlnKI。

[ Last edited by weishenme on 2008-7-12 at 06:18 ]
3楼2008-07-10 20:26:54
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

谢谢了!不过您能确定吗?呵呵,

因为根据你的这个公式结合自由能与KI成反比,而实际上他俩是成正比的啊

[ Last edited by gwdavid on 2008-7-11 at 10:37 ]
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
4楼2008-07-11 10:35:32
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weishenme

金虫 (小有名气)


suntao1982(金币+1,VIP+0):谢谢交流!
引用回帖:
Originally posted by gwdavid at 2008-7-11 10:35:
谢谢了!不过您能确定吗?呵呵,

因为根据你的这个公式结合自由能与KI成反比,而实际上他俩是成正比的啊

[ Last edited by gwdavid on 2008-7-11 at 10:37 ]

公式我把R写成k了,现在已经改好了。
atuodock里计算的binding energy就等于RTlnKI,把负号去掉了。你可以自己验算一下。

[ Last edited by weishenme on 2008-7-12 at 06:55 ]
5楼2008-07-12 06:35:57
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

非常感谢!
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
6楼2008-07-12 15:24:23
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

楼上的虫友,能不能再问一下KI和IC50的关系是什么?
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
7楼2008-07-13 22:31:31
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