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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 【求助】有关autodock的问题？
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

[交流] 【求助】有关autodock的问题？


Autodock的结果中Binding energy的下面有一项是KI值，这个值的英文的是：Inhibition_constant，单位是pM/nM/uM/mM等，并随binding energy的增大而增大，即排在第一位的KI值最小，请问这个值的含义是什么？


[ Last edited by gwdavid on 2008-7-10 at 12:25 ]
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1楼 2008-07-09 19:14:04
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weishenme

金虫 (小有名气)
★
suntao1982(金币+1,VIP+0):xiexie
根据结合能计算的结合常数吧，印象里ΔG＝-RTlnKI。

[ Last edited by weishenme on 2008-7-12 at 06:18 ]
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3楼2008-07-10 20:26:54
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
自己顶啊，请高手帮忙！
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个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
2楼2008-07-10 12:19:34
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
谢谢了！不过您能确定吗？呵呵，

因为根据你的这个公式结合自由能与KI成反比，而实际上他俩是成正比的啊

[ Last edited by gwdavid on 2008-7-11 at 10:37 ]
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4楼2008-07-11 10:35:32
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weishenme

金虫 (小有名气)
★
suntao1982(金币+1,VIP+0):谢谢交流!
引用回帖:
Originally posted by gwdavid at 2008-7-11 10:35:
谢谢了！不过您能确定吗？呵呵，

因为根据你的这个公式结合自由能与KI成反比，而实际上他俩是成正比的啊

[ Last edited by gwdavid on 2008-7-11 at 10:37 ]

公式我把R写成k了，现在已经改好了。
atuodock里计算的binding energy就等于RTlnKI，把负号去掉了。你可以自己验算一下。

[ Last edited by weishenme on 2008-7-12 at 06:55 ]
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5楼2008-07-12 06:35:57
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