24小时热门版块排行榜    

查看: 765  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

weleozhu

银虫 (小有名气)

[求助] 使用Sau3AI建立水稻shotgun库,但连接多次不长,求经验大神帮助 已有1人参与

我最近在构建一个水稻的shotgun亚克隆文库,质粒来源是水稻的BAC文库的一个BAC质粒,使用的是PUC19作为载体,回收的片段为7-10K,酶切质粒条件摸索得差不多了,在目的区域也有比较集中的片段,然后切胶回收后,连接到用BamHI酶切然后用NEB CIP脱磷的PUC19上,问题就出在这,连接转化后就是不见一个菌斑。  我转化的菌株是XL1-Blue,用的是电转化, 感受态效率已经经过验证,没有问题,符合建库要求。最近被这个快烦死了,都快两个月了,求求大神棒棒忙,或者改一下方案也行。问题解决了加送金币。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weleozhu

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by BAC 文库 at 2016-02-25 08:43:25
今天又看到了该帖,再次说一下我的观点。我建议你换一管新的BamHI 没切载体试一下,然后做一个NEB CIP脱磷前PUC19载体的自连实验,转化后看载体的自连率有多高。上述实验失败,有可能是载体完全没有切开,片段没法连 ...

谢谢,我现在没有再做了,马上毕业了,留下来 算是对后来人的一个经验。
4楼2016-02-25 17:29:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

BAC 文库

新虫 (初入文坛)

盐离子浓度、载体与片段的摩尔比对连接影响很大,可以做个预连接、转化,多摸索几个梯度尝试一下。
2楼2016-01-18 17:23:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

BAC 文库

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
weleozhu: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 后面的童鞋可以试试 2016-02-25 17:30:36
今天又看到了该帖,再次说一下我的观点。我建议你换一管新的BamHI 没切载体试一下,然后做一个NEB CIP脱磷前PUC19载体的自连实验,转化后看载体的自连率有多高。上述实验失败,有可能是载体完全没有切开,片段没法连接进去,用CIP脱磷处理后,也不存在载体自连接的情况,故转化后一个菌落都没有。以前我们实验室也碰到过这样的情况。载体酶切时适当的延长酶切的时间,连接时置入4℃冰箱,延长连接的时间。
3楼2016-02-25 08:43:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 5/250 2026-11-07 17:01 by Xc2FxHsHkBNc
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 4/200 2026-11-07 16:50 by Xc2FxHsHkBNc
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 5/250 2026-11-07 16:17 by Xc2FxHsHkBNc
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 5/250 2026-11-07 16:06 by Xc2FxHsHkBNc
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 23/1150 2026-11-07 06:49 by Equinoxhua
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +10 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 22/1100 2026-11-06 17:18 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 14/700 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 15/750 2026-11-06 13:49 by BkA9Bi5cMhkD
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 17/850 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 5/250 2026-11-06 09:01 by 2lRNluKrJpwL
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 04:47 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-06 01:51 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:42 by qL1cU46YIdK0
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 11:10 by PYZmcHr5kSaq
信息提示
请填处理意见