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agou

金虫 (正式写手)

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[交流] 质子是应该加在羧基上还是水上？

我的好几个样品的情况是这样的：羧基配位，结构中还有配位水和游离水。
若考虑电荷平衡，必须从部分羧基O或水上指认H原子，即可能存在部分质子化的羧基配位或者存在部分质子化的水(所有羧基质子化以及全部水质子化电荷也不平衡)。
文献中质子化羧基配位以及质子水存在的情况都有。有些文献中提及的红外图谱指认法也很模糊（ICC-2003-6-244）。有人提及没脱质子的羧基在1700左右有峰，脱质子的1600左右有峰不知道以此为根据是否可靠，且如果结构中即存在脱质子又存在不妥质子的羧基也无能为力。

还有，如果存在质子水，TGA中加热，水分子的失去是不是会伴随着结构的坍塌？可否借用这个“结论”用TGA图反过来判断是羧基还是水质子化了？

我现在一直没有明确的思路去判断质子该加在哪里，忘得到高手指点。

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小木虫三戒总理事

1楼2015-04-23 10:50:01

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按时到岗撒娇

新虫 (正式写手)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by lich666 at 2015-04-23 11:06:33
先看数据好不好，如果好的话可以看到氢的Q峰。
再看羧基键长，键长如果大于1.3，氢就应该在这个键上。
最好所有的氢都有氢键联系，才好修收敛。

老师您好最近我在解析一个晶体数据的时候发现一个羧基没有脱去质子，但是加不上去氢。键长为1.285,1.224.从键长来看应该是脱掉质子的，但是Grow不了，同时假如该羧基脱掉了质子，则电荷不平衡。数据质量一般偏差，客体分子并没有定出来，（有可能会影响电荷平衡）想请教一下是数据太差造成的加氢加不上么？有什么办法解决么？非常感谢。