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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » shelxtl 解析晶体 转换坐标
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shuyuan09

木虫 (小有名气)

[求助] shelxtl 解析晶体 转换坐标 已有1人参与

审稿人提出的晶体学问题：
the five atoms N7, C18, C19, H18, H19 should be moved to(-x,y,1/2-z) to generate a completely connected php ligand,.  Then redo the refinement, remake the CIF and refresh the text, etc. All that the authors need then do is to take their new SHELXL.
这个问题怎么解决，跪求帮助。
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选我所选，爱我所爱
1楼 2015-04-22 03:43:46
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匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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shuyuan09: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-04-22 18:48:09
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2楼2015-04-22 08:50:12
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shuyuan09

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lich666 at 2015-04-22 08:50:12
要把提到的原子移动到另外一个不对称单元里，从而使配体完整。

具体怎么操作呢
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选我所选，爱我所爱
3楼2015-04-22 15:56:02
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匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信
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4楼2015-04-22 16:36:53
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shuyuan09

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lich666 at 2015-04-22 16:36:53
直接上数据吧。。。...

因为有好几个晶体都是这个问题，所以请您知道我操作下，在哪个界面（xp?）用什么命令
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选我所选，爱我所爱
5楼2015-04-22 16:49:56
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匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信
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6楼2015-04-22 18:44:43
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shuyuan09

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lich666 at 2015-04-22 08:50:12
要把提到的原子移动到另外一个不对称单元里，从而使配体完整。

谢谢了
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选我所选，爱我所爱
7楼2015-04-22 18:48:47
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by shuyuan09 at 2015-04-22 18:48:47
谢谢了...

在XP里面需要用到envi和sgen这两个命令。
比如说，要把C2移到C1旁边，命令如下:
envi C1  //这时软件会给出这样的话：C2 5666(对称码) ……
sgen C2 5666  //软件提示a new atom C2A has been generated类似这样的话
kill C2  //删掉原来的C2
name C2A C2  //把新生成的C2A命名为C2
file  //保存到ins
在这之后就是直接XL精几轮就OK了
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8楼2015-04-23 07:55:22
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etongtong

铁杆木虫 (著名写手)
在XP命令行中，
1 找的相连的原子比如C88
2 用envi命令找的它旁边原子及其对冲操作代码，这个代码是一个4 digits 例如 3555
3 用sgen命令做这个对称操作，格式为：sgen c88 3555
4 用kill杀掉原来的原子，用labl 命名新原子为原来的原子名
5 用file命令保存现在的文件
退出xp, 执行XL直到数据收敛
你看我这么辛苦，你给我转点金币吧
赞一下(1人) 回复此楼
▄︻┻┳═一................................................
9楼2015-04-23 08:17:08
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