24小时热门版块排行榜    

查看: 1156  |  回复: 7
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lawnw

木虫 (小有名气)

[交流] 有奖求助:关于Build layer的问题,谢谢(已解决)

我在用Build Vacuum Slab dialog to change the periodicity from 2D to 3D.
出现了如图1所示的问题,后来通过求助,得知要在Display style | lattice中选择Display style为Original,这样就不会出现如图1所示的顶层出现一层原子的问题。

但是,我接着用Build | Build Layers,将3个layer连接起来,结果出现了如图2所示的情形,在第一层和第二层之间又多出一层氢原子,我试着调整了Display style | lattice中选择Display style为Original,不起作用,还请高人不吝指教,如果图2不需调整,不知道会不会对接下来的Discover dynamics产生影响?

体系解释说明

我研究的体系是这样的,第一层是氢氧化镁的(001)晶面,上面有10A的真空片层,第二层是含有吸附分子(一个有机硅烷分子)的水层,如图3,第三层则只含有水分子,相当于一个盖子,覆盖在第二层上面。我要计算的是有机硅烷在氢氧化镁表面吸附的动力学过程,使用Discover的Dynamics模块,但是在build layer时则在第一层与第二层之间出现了一层氢原子,按说它应该在第一层的最底部(从图二可以看出,第一层底部的氢原子不见了),现在则跑到第一层和第二层之间,不知道应该如何解决,还请高手不吝指教,谢谢。

我愿拿出金币答谢帮助的高手,谢谢。

[ Last edited by lawnw on 2008-7-7 at 20:04 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lawnw

木虫 (小有名气)

回复

★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):qqq
加真空片层是做模拟时通行的,我在论坛上看到一般是10A左右,具体的你可以查文献,移动是使用MS的Move工具
6楼2008-07-08 08:57:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

mengsk

金虫 (著名写手)


lawnw(金币+1,VIP+0):谢谢,虽然没有解决问题,还是鼓励一下。
你是想在表面上加水层吧?直接把水箱加在底层上就行了。加真空层的目的是研究分子在表面吸附时,将其变为3维周期体系。
奋斗中的小木虫
2楼2008-07-07 11:26:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lawnw

木虫 (小有名气)

体系解释说明

我研究的体系是这样的,第一层是氢氧化镁的(001)晶面,上面有10A的真空片层,第二层是含有吸附分子(一个有机硅烷分子)的水层,第三层则只含有水分子,相当于一个盖子,负载上第二层上面。我要计算的是有机硅烷在氢氧化镁表面吸附的动力学过程,使用Discover的Dynamics模块,但是在build layer时则在第一层与第二层之间出现了一层氢原子,按说它应该在第一层的最底部,现在则跑到上面来了,不知道应该如何解决,还请高手不吝指教,谢谢。
3楼2008-07-07 14:37:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

saitou

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lawnw(金币+9,VIP+0):太感谢,问题已经解决。
周期重复的问题吧,试试把出问题的层的原子向上移动,空出一点真空层,然后在layer组合
不抛弃,不放弃
4楼2008-07-07 16:36:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +33 医学老男孩 2026-08-13 79/3950 2026-08-17 14:00 by GZUZM
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 6GojgJvkDudM 2026-08-16 6/300 2026-08-17 13:58 by EYK67XJMj64E
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 6GojgJvkDudM 2026-08-16 4/200 2026-08-17 13:49 by EYK67XJMj64E
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +12 Ldrop2023 2026-08-13 13/650 2026-08-17 12:33 by gltch
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 i7NFEVbjQMM5 2026-08-16 4/200 2026-08-17 12:10 by 4GBAYCdVQoK3
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 6GojgJvkDudM 2026-08-16 4/200 2026-08-17 11:46 by 4GBAYCdVQoK3
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 6GojgJvkDudM 2026-08-16 3/150 2026-08-17 09:49 by xLVPIRuSvCUe
[论文投稿] 岩土工程学报什么时候才能终审完呐 25+3 yeager111 2026-08-10 4/200 2026-08-16 20:42 by tfang
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 6/300 2026-08-16 20:07 by 奶牛小黑
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
信息提示
请填处理意见