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Jiansh

新虫 (小有名气)

[求助] gaussian LSF 运行 已有2人参与

如题,请问一下在超算中心的LSF平台上怎么运行gaussian

可以在节点下g09 +xx.com 运行
bsub提交 怎么才能是让其单节点多核并行,哎每次各种错误....
有没有哪位弄过,稍微介绍一下
之前主要用vasp,编译并行用mpi/openmp之类的,但是高斯,完全不知道高斯并行机制,好像单纯的一个%nprcshare=   搞不定
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Jiansh: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-04-18 08:57:57
gmy1990: 金币+2, 谢谢交流 2015-04-19 22:36:25
gaussian的单节点并行,指定%nproc应该就可以了

关键是lsf的脚本里要指定cpu数
因为很多年不用了,具体已经不记得怎么写了

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2015-04-18 07:02:02
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Jiansh

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by qchem at 2015-04-18 07:02:02
gaussian的单节点并行,指定%nproc应该就可以了

关键是lsf的脚本里要指定cpu数
因为很多年不用了,具体已经不记得怎么写了

好的,谢谢,我去试试
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3楼2015-04-18 08:57:50
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zhangdy

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

试试下面这段:
APP_NAME=队列名
NP=12
NP_PER_NODE=12
RUN="RAW"
CURDIR=$PWD

input=aaa        # aaa为你的输入文件名

## Gaussian 09 setup
export g09root=/xxxx/Gaussian.D01.Linda        #请将xxxx换成你的高斯所在路径
export GAUSS_SCRDIR=~/scratch
export GAUSS_EXEDIR=$g09root/g09
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$g09root/g09
export PATH=$g09root/g09:$PATH
source $g09root/g09/bsd/g09.profile

g09 < $input >& $input.log
4楼2015-07-07 11:55:06
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damihu2011

银虫 (职业作家)

请问使用高性能中心,高斯提交任务,都提交哪些呢?lsf文件,和gjf文件?
我的眼里只有苯环
5楼2016-06-22 19:36:07
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damihu2011

银虫 (职业作家)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangdy at 2015-07-07 11:55:06
试试下面这段:
APP_NAME=队列名
NP=12
NP_PER_NODE=12
RUN="RAW"
CURDIR=$PWD

input=aaa        # aaa为你的输入文件名

## Gaussian 09 setup
export g09root=/xxxx/Gaussian.D01.Linda        #请将xxxx换 ...

请问高性能中心,高斯如何提交文件?提交lsf文件就可以了吗?
我的眼里只有苯环
6楼2016-06-22 19:38:50
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