| 查看: 590 | 回复: 0 | |||
[求助]
BLAST到的标准菌株做树时与被测菌不聚在一起，怎么回事？
|
|
无论从NCBI上BLAST的结果，还是从RDP数据库里match到的，都显示检测菌16S rRNA基因与Bacillus megaterium 相似度最高，其次是Bacillus aryabhattai，可是把这两个标准菌株的序列下载下来，再加上其他部分bacillus属的菌，还用了一个Staphylococcus 属的作为外部参照，结果做的树检测菌不仅不和Bacillus megaterium 、Bacillus aryabhattai 聚在一起，亲缘关系 比那个参照的还远，这是怎么回事啊？两个数据库里查出来的都是些bacillus属的，又都聚不到一起 而且，我用clustalx比对检测菌和Bacillus megaterium 、Bacillus aryabhattai 的序列时，检测菌跟两个标准菌的差异好大啊，为什么还会BLAST到它们呢？ 哪位遇到过相似的问题？谁能帮我解答一下，多谢了！ |
回复此楼» 猜你喜欢
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福
已经有11人回复
-
表哥与省会女结婚，父母去帮带孩子被省会女气回家生重病了
已经有7人回复
-
同年申请2项不同项目，第1个项目里不写第2个项目的信息，可以吗
已经有8人回复
-
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有7人回复
-
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有10人回复
-
天津大学招2026.09的博士生，欢迎大家推荐交流（博导是本人）
已经有9人回复
-
有院领导为了换新车，用横向课题经费买了俩车
已经有10人回复
-
AI 太可怕了，写基金时，提出想法，直接生成的文字比自己想得深远，还有科学性
已经有6人回复
-
酰胺脱乙酰基
已经有13人回复
点击这里搜索更多相关资源