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BLAST到的标准菌株做树时与被测菌不聚在一起，怎么回事？
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无论从NCBI上BLAST的结果，还是从RDP数据库里match到的，都显示检测菌16S rRNA基因与Bacillus megaterium 相似度最高，其次是Bacillus aryabhattai，可是把这两个标准菌株的序列下载下来，再加上其他部分bacillus属的菌，还用了一个Staphylococcus 属的作为外部参照，结果做的树检测菌不仅不和Bacillus megaterium 、Bacillus aryabhattai 聚在一起，亲缘关系 比那个参照的还远，这是怎么回事啊？两个数据库里查出来的都是些bacillus属的，又都聚不到一起 而且，我用clustalx比对检测菌和Bacillus megaterium 、Bacillus aryabhattai 的序列时，检测菌跟两个标准菌的差异好大啊，为什么还会BLAST到它们呢？ 哪位遇到过相似的问题？谁能帮我解答一下，多谢了！ |
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