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ggyy0911

铁虫 (正式写手)

[求助] 毕赤酵母电转后在平板上单克隆应该太小太密,难以筛选怎么办? 已有1人参与

我这几次做的pPIC9k电转GS115,电转后涂的RDB板,长出来的菌落非常的小而且密,搞的就很难把它影印到MM和MD板上进行筛选,很难标记。
我看我同门的是稀稀落落几颗一个平板上,感觉她的又太少了,因为手册上一般是筛选100个左右,她一个平板就6、7个的样子。
我之后还打算在MD和MM上筛选Mut+和Muts,再上G418平板,因为之前存在只有RDB板上的菌可以表达,转到其他板上后就无法表达的情况,所以最好在筛选后还能对应上最初的RDB平板上的菌落。
  我用Sac I线性化的9k,因为理论上插入HIS区(即用Sal I)的话只产生Mut+,而有文献说对于大分子量蛋白Muts更适合表达。表达手册上说Sac I也应该只产生Mut+,可是看了很多文献还是进行了Mut+和Muts的筛选。
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Dearstar

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

楼主你要是浓度太高,可以刮下来,用无菌水稀释再重新涂布,这样会好很多。
我现在在也做一个类似的实验,对于理论上是mut+型,为什么还要做这一个筛选,我也一直有这个疑问。。难道是突变了,因为它们基因上有97%的同源性。。?
共勉之
引用操作手册上的原话:
毕赤酵母中有两个基因编码醇氧化酶-AOX1  及  AOX2。细胞中大多数的醇氧化酶是
AOX1 基因产物。甲醇可紧密调节、诱导 AOX1 基因的高水平表达,较典型的是占可溶性
蛋白的 30%以上。AOX1 基因已被分离,含 AOX1 启动子的质粒可用来促进编码外源蛋白
的目的基因的表达。AOX2 基因与 AOX1 基因有 97%的同源性,但在甲醇中带 AOX2 基因
的菌株比带 AOX1 基因菌株慢得多,通过这种甲醇利用缓慢表型可分离 Muts 菌株。AOX1 突变表型:
缺失  AOX1  基因,会丧失大部分的醇氧化酶活性,产生一种表型为  Muts  的突变株
(methanol  utilization  slow),过去称为 Mut,而 Muts 可更精确地描述突变子的表型。结果
细胞代谢甲醇的能力下降,因而在甲醇培养基中生长缓慢。Mut +
(methanol utilization plus)
指利用甲醇为唯一碳源的野生型菌株。这两种表型用来检测外源基因在毕赤酵母转化子中的
整合方式。
2楼2015-06-04 09:27:07
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ggyy0911

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Dearstar at 2015-06-04 09:27:07
楼主你要是浓度太高,可以刮下来,用无菌水稀释再重新涂布,这样会好很多。
我现在在也做一个类似的实验,对于理论上是mut+型,为什么还要做这一个筛选,我也一直有这个疑问。。难道是突变了,因为它们基因上有97% ...

你的方法真是简单粗暴,我喜欢,确实之前没想到……我后来转化涂了不同菌液量的板,菌落少的那个板一样是长不大,我看网上有人说这是转化效率低,所以才小,所以在考虑用很久以前一篇文献提的那个高效酵母感受态制备方法。我最近做表达一直做不出来,各种纠结。至于mut和muts,我觉得做MM和MD似乎是没有意义的,因为我筛选的时候很明显有的在MM上偏小,但用通用引物验证都是mut,所以我认为应该以pcr验证为准。希望咱俩能多交流交流~

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2015-06-04 13:28:35
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MeiPD

新虫 (小有名气)

你好,我的跟你一样,涂抗性平板,长出来的白色一层,很小很密集,根本没办法挑单菌落。后来我又重新转化涂MD平板筛选,结果一样,且未转化酵母涂MD的阴性对照也是这样,楼主你问题解决了吗?

发自小木虫Android客户端
4楼2017-06-24 20:23:57
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gaiyin1002

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by MeiPD at 2017-06-24 20:23:57
你好,我的跟你一样,涂抗性平板,长出来的白色一层,很小很密集,根本没办法挑单菌落。后来我又重新转化涂MD平板筛选,结果一样,且未转化酵母涂MD的阴性对照也是这样,楼主你问题解决了吗?
...

楼主,我也是同样的问题,请问解决了吗?
5楼2018-11-26 10:40:40
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