24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1284  |  回复: 6
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 淡如水 的 2 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

淡如水

金虫 (正式写手)

[交流] 关于势能面扫描的问题

我想扫描一个完整的势能面出来(当分子结构中的两个二面角发生变化时),但是仅仅用scan关键字扫描的话,缺少了优化构型的过程,是刚性扫描,得到的结果不是很准确。
是不是需要用opt=Modredundant来进行平缓势能面扫描?
刚性扫描和平缓势能面扫描哪个更合理一些?
谢谢!

[ Last edited by 淡如水 on 2008-7-3 at 17:52 ]
回复此楼
当你再没有什么可以失去的时候,就是你开始得到的时候。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

淡如水

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 北京一叶567 at 2008-7-3 23:20:
所有势能扫描之前,都得先opt吧,无论是刚性还是柔性。opt=modredun也应该建立在已经优化的分子基础上。我一般用柔性,很少直接用scan。以上个人意见,仅供参考。

但是在《Exploring Chemistry with Electronic Structure Method》这本书中有这么一段话:

8.4 势能面扫描
势能面扫描可以研究一个区域内的势能面。一般的扫描都是由一系列的在不同结构上的单点能计算组成的。当进行势能面扫描时,要设置分子结构的变量,设置需要变化的结构的范围和步长。
在Gaussian中,势能面扫描是自动进行的,下面是一个进行势能面扫描的算例。
#T UMP4/6-311+G(d,p) Scan Test
CH PES Scan
0 2
C
H 1 R
R 0.5 40 0.04
该算例要求一个对于CH的势能面扫描,所用的关键词是scan,变量的设置格式是:
名称  初始值 [点数  步长]
当只有一个参数时,变量在整个扫描中是不变的,当三个参数都设定时,变量将在一定范围内变化。当有多个变量时,所有的可能构型都要计算。所有等级的计算结果都在输出文件中列出,比如进行的MP2的势能面扫描也将列出HF方法的结果。根据得到的扫描结果,可以得到所要的势能面,通过它,可能得到极小值的可能位置。势能面扫描过程中不进行几何优化。

如果说不能用scan,这个怎么解释呢?
当你再没有什么可以失去的时候,就是你开始得到的时候。
7楼2008-07-04 13:39:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

cuihang

铁杆木虫 (正式写手)

VASPer

★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):qqq
刚性扫描毕竟还是不太可靠吧,但是要考虑计算量能不能承受
聪明人知道自己是傻子,傻子以为自己是聪明人
2楼2008-07-03 18:47:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

虚谦

至尊木虫 (正式写手)

★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):qqq
我感觉应该是柔性扫描会合理一些,但是时间会很长!恐怕不能接受!
大家都说我是个好人,其实,我也是这么想的~!
3楼2008-07-03 20:13:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

淡如水

金虫 (正式写手)

楼上两位说的都非常有道理,我的问题是:
一般用到paper中的势能面图是刚性扫描还是平缓势能面扫描?
谢谢!
当你再没有什么可以失去的时候,就是你开始得到的时候。
4楼2008-07-03 21:58:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 309求调剂 +4 wdhw 2026-04-10 5/250 2026-04-10 13:49 by ajpv风雷
[考研] 0702物理学学硕299求调剂 +6 祁柒连 2026-04-06 6/300 2026-04-10 11:10 by Roomoo
[考研] 调剂申请086000一志愿西北农林科技大学生物与医药320分-本科齐鲁工业大学 +3 美美女士 2026-04-09 3/150 2026-04-10 10:31 by liuhuiying09
[考研] 085601初试330分找调剂 +10 流心奶黄包l 2026-04-09 10/500 2026-04-10 08:14 by Sammy2
[考研] 070300化学学硕311分求调剂 +12 梁富贵险中求 2026-04-04 14/700 2026-04-10 08:07 by kangsm
[考研] 297求调剂 +22 ljy20040718! 2026-04-03 24/1200 2026-04-09 20:48 by yanenwang
[考研] 本科郑州大学,一志愿华东师范大学282求调剂 +23 熊哥xtk 2026-04-07 26/1300 2026-04-09 17:17 by 18446523
[考研] 调剂 +12 月@163.com 2026-04-08 12/600 2026-04-09 14:27 by rl1980
[考研] 一志愿985初试354分生物调剂 +3 031001 2026-04-06 3/150 2026-04-09 00:30 by Evan_Liu
[考研] 生物学学硕,初试351分,求调剂 +4 …~、王…~ 2026-04-08 5/250 2026-04-08 21:49 by limeifeng
[考研] 考研求调剂 +4 雯??? 2026-04-08 4/200 2026-04-08 21:44 by 土木硕士招生
[考研] 264求调剂 +11 麦小叮当 2026-04-07 11/550 2026-04-08 16:05 by 一只好果子?
[考研] 388求调剂 +6 四川王涛 2026-04-07 8/400 2026-04-08 00:17 by JourneyLucky
[考研] 生物学学硕求调剂:351分一志愿南京师范大学生物学专业 +6 …~、王…~ 2026-04-06 7/350 2026-04-06 18:54 by macy2011
[考研] 085405软件工程301分求调剂,专硕可跨专业,四六级已过 +3 静静想想 2026-04-05 3/150 2026-04-06 15:23 by nepu_uu
[考研] 求调剂 +7 张.1 2026-04-05 7/350 2026-04-05 20:40 by 啵啵啵0119
[考研] 278求调剂 +14 范婷娜 2026-04-04 15/750 2026-04-04 22:15 by lqwchd
[考研] 272求调剂 +4 松柏常青5 2026-04-03 4/200 2026-04-04 17:03 by babysonlkd
[考研] 309求调剂 +4 快乐的小白鸽 2026-04-04 5/250 2026-04-04 15:55 by cql1109
[考研] 化工求调剂 +11 荔香芝士椰奶 2026-04-03 11/550 2026-04-03 22:06 by 啵啵啵0119
信息提示
请填处理意见