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淡如水

金虫 (正式写手)

[交流] 关于势能面扫描的问题

我想扫描一个完整的势能面出来(当分子结构中的两个二面角发生变化时),但是仅仅用scan关键字扫描的话,缺少了优化构型的过程,是刚性扫描,得到的结果不是很准确。
是不是需要用opt=Modredundant来进行平缓势能面扫描?
刚性扫描和平缓势能面扫描哪个更合理一些?
谢谢!

[ Last edited by 淡如水 on 2008-7-3 at 17:52 ]
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虚谦

至尊木虫 (正式写手)

★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):qqq
我感觉应该是柔性扫描会合理一些,但是时间会很长!恐怕不能接受!
大家都说我是个好人,其实,我也是这么想的~!
3楼2008-07-03 20:13:20
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cuihang

铁杆木虫 (正式写手)

VASPer

★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):qqq
刚性扫描毕竟还是不太可靠吧,但是要考虑计算量能不能承受
聪明人知道自己是傻子,傻子以为自己是聪明人
2楼2008-07-03 18:47:21
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淡如水

金虫 (正式写手)

楼上两位说的都非常有道理,我的问题是:
一般用到paper中的势能面图是刚性扫描还是平缓势能面扫描?
谢谢!
当你再没有什么可以失去的时候,就是你开始得到的时候。
4楼2008-07-03 21:58:09
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python9527

金虫 (小有名气)

顶一个!我也碰到同样的问题了!!

我在做一个顺反异构 ,用opt=Modredundant来进行平缓势能面扫描发现 2 二面角没有变 但是终点的时候获得 的构型与 没有固定2面角的所优化点有偏差 !!

并且 势能面 不是很平滑!!

请高人 赐教!!!文献上 一般只给出 是 pes 没有说明是  刚性还是柔性的
5楼2008-07-03 22:29:59
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