24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1283  |  回复: 6
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 淡如水 的 2 个金币

淡如水

金虫 (正式写手)

[交流] 关于势能面扫描的问题

我想扫描一个完整的势能面出来(当分子结构中的两个二面角发生变化时),但是仅仅用scan关键字扫描的话,缺少了优化构型的过程,是刚性扫描,得到的结果不是很准确。
是不是需要用opt=Modredundant来进行平缓势能面扫描?
刚性扫描和平缓势能面扫描哪个更合理一些?
谢谢!

[ Last edited by 淡如水 on 2008-7-3 at 17:52 ]
回复此楼
当你再没有什么可以失去的时候,就是你开始得到的时候。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cuihang

铁杆木虫 (正式写手)

VASPer

★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):qqq
刚性扫描毕竟还是不太可靠吧,但是要考虑计算量能不能承受
聪明人知道自己是傻子,傻子以为自己是聪明人
2楼2008-07-03 18:47:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

虚谦

至尊木虫 (正式写手)

★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):qqq
我感觉应该是柔性扫描会合理一些,但是时间会很长!恐怕不能接受!
大家都说我是个好人,其实,我也是这么想的~!
3楼2008-07-03 20:13:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

淡如水

金虫 (正式写手)

楼上两位说的都非常有道理,我的问题是:
一般用到paper中的势能面图是刚性扫描还是平缓势能面扫描?
谢谢!
当你再没有什么可以失去的时候,就是你开始得到的时候。
4楼2008-07-03 21:58:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

python9527

金虫 (小有名气)

顶一个!我也碰到同样的问题了!!

我在做一个顺反异构 ,用opt=Modredundant来进行平缓势能面扫描发现 2 二面角没有变 但是终点的时候获得 的构型与 没有固定2面角的所优化点有偏差 !!

并且 势能面 不是很平滑!!

请高人 赐教!!!文献上 一般只给出 是 pes 没有说明是  刚性还是柔性的
5楼2008-07-03 22:29:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

北京一叶567

木虫 (小有名气)

★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):qqq
所有势能扫描之前,都得先opt吧,无论是刚性还是柔性。opt=modredun也应该建立在已经优化的分子基础上。我一般用柔性,很少直接用scan。以上个人意见,仅供参考。
6楼2008-07-03 23:20:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

淡如水

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 北京一叶567 at 2008-7-3 23:20:
所有势能扫描之前,都得先opt吧,无论是刚性还是柔性。opt=modredun也应该建立在已经优化的分子基础上。我一般用柔性,很少直接用scan。以上个人意见,仅供参考。

但是在《Exploring Chemistry with Electronic Structure Method》这本书中有这么一段话:

8.4 势能面扫描
势能面扫描可以研究一个区域内的势能面。一般的扫描都是由一系列的在不同结构上的单点能计算组成的。当进行势能面扫描时,要设置分子结构的变量,设置需要变化的结构的范围和步长。
在Gaussian中,势能面扫描是自动进行的,下面是一个进行势能面扫描的算例。
#T UMP4/6-311+G(d,p) Scan Test
CH PES Scan
0 2
C
H 1 R
R 0.5 40 0.04
该算例要求一个对于CH的势能面扫描,所用的关键词是scan,变量的设置格式是:
名称  初始值 [点数  步长]
当只有一个参数时,变量在整个扫描中是不变的,当三个参数都设定时,变量将在一定范围内变化。当有多个变量时,所有的可能构型都要计算。所有等级的计算结果都在输出文件中列出,比如进行的MP2的势能面扫描也将列出HF方法的结果。根据得到的扫描结果,可以得到所要的势能面,通过它,可能得到极小值的可能位置。势能面扫描过程中不进行几何优化。

如果说不能用scan,这个怎么解释呢?
当你再没有什么可以失去的时候,就是你开始得到的时候。
7楼2008-07-04 13:39:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 淡如水 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿沪9,326生物学求相关专业调剂 +4 刘墨墨 2026-04-09 4/200 2026-04-10 12:07 by pengliang8036
[考研] 药学专硕调剂 +5 ? 一路生?花? 2026-04-10 6/300 2026-04-10 11:54 by pengliang8036
[考研] 材料与化工300求调剂 +30 肖开文 2026-04-09 32/1600 2026-04-10 10:59 by 紫翼精灵
[考研] 一志愿211 0703化学 346分求调剂 +22 土豆er? 2026-04-09 23/1150 2026-04-10 10:58 by 高维春
[考研] 本科211 工科085400 280分求调剂 可跨专业 +8 LZH(等待调剂中 2026-04-10 8/400 2026-04-10 10:39 by xujun0624
[考研] 材料专硕283求调剂 +18 试试看呗 2026-04-04 19/950 2026-04-10 10:05 by may_新宇
[考研] 286求调剂 +6 草木不言 2026-04-04 6/300 2026-04-09 21:06 by 286640313
[考研] 085400 328分 求调剂 +8 喂你一个大橙子 2026-04-09 12/600 2026-04-09 19:20 by zl8213662
[考研] 296求调剂 +5 汪!?! 2026-04-09 5/250 2026-04-09 17:47 by 柠檬不酸zy
[考研] 349学科化学045106求调剂,化学类都可以 +8 保好懂懂 2026-04-08 8/400 2026-04-09 14:03 by xulei3024
[考研] 求助071001调剂!!! +7 黄守松 2026-04-05 8/400 2026-04-09 09:07 by 徐良白眉大侠
[考研] 二次调剂求老师收留 +3 笑笑袁 2026-04-08 3/150 2026-04-08 23:50 by 醉在风里
[考研] 318求调剂 +13 ykyhsa 2026-04-05 15/750 2026-04-08 21:37 by wj165256
[考研] 085602调剂 初试总分335 +10 19123253302 2026-04-05 10/500 2026-04-07 15:23 by 小乔同学ya
[考研] 334分机械专硕求调剂 +3 蛋花紫菜汤 2026-04-03 3/150 2026-04-07 14:49 by 逍遥cocoa
[考研] 考研调剂 +7 15615482637 2026-04-04 7/350 2026-04-06 22:56 by chenzhimin
[考研] 285求调剂 +8 AZMK 2026-04-04 11/550 2026-04-06 13:56 by BruceLiu320
[考研] 材料化工306分找合适调剂 +14 沧海轻舟e 2026-04-04 14/700 2026-04-05 09:53 by 朱云虎202
[考研] 22408,264求调剂 +3 ywh729 2026-04-03 4/200 2026-04-04 11:04 by ywh729
[考研] 考研求调剂 +3 木心想继续深造 2026-04-03 3/150 2026-04-03 21:56 by 啵啵啵0119
信息提示
请填处理意见