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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化新手直通车 » 在接赝势原子优化后计算拉曼频率出现错误 刚运行就死
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菜鸟都不算

新虫 (小有名气)

[求助] 在接赝势原子优化后计算拉曼频率出现错误 刚运行就死 已有2人参与

Entering Link 1 = E:\gs09\G09W\l1.exe PID=     10912.
  
Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998,2003,2009,2013,
            Gaussian, Inc.  All Rights Reserved.
  
This is part of the Gaussian(R) 09 program.  It is based on
the Gaussian(R) 03 system (copyright 2003, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 98 system (copyright 1998, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 94 system (copyright 1995, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 92(TM) system (copyright 1992, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 90(TM) system (copyright 1990, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 88(TM) system (copyright 1988, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 86(TM) system (copyright 1986, Carnegie Mellon
University), and the Gaussian 82(TM) system (copyright 1983,
Carnegie Mellon University). Gaussian is a federally registered
trademark of Gaussian, Inc.
  
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including trade secrets, belonging to Gaussian, Inc.
  
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Use, reproduction and disclosure by the US Government is
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Rights clause in FAR 52.227-19.
  
Gaussian, Inc.
340 Quinnipiac St., Bldg. 40, Wallingford CT 06492
  
  
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assistance to any competitor of Gaussian, Inc.  The licensee
of this program is prohibited from giving any competitor of
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the user acknowledges that Gaussian, Inc. is engaged in the
business of creating and licensing software in the field of
computational chemistry and represents and warrants to the
licensee that it is not a competitor of Gaussian, Inc. and that
it will not use this program in any manner prohibited above.
---------------------------------------------------------------
  

Cite this work as:
Gaussian 09, Revision D.01,
M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria,
M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci,
G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian,
A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada,
M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima,
Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr.,
J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers,
K. N. Kudin, V. N. Staroverov, T. Keith, R. Kobayashi, J. Normand,
K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi,
M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross,
V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann,
O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski,
R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth,
P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels,
O. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski,
and D. J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2013.

******************************************
Gaussian 09:  IA32W-G09RevD.01 24-Apr-2013
                10-Apr-2015
******************************************
%chk=E:\yb\shamingdan\3ag\3ag.chk
-------------------------------------------------------------------
# b3lyp/gen guess=read geom=check extrabasis pseudo=read freq=raman
-------------------------------------------------------------------
1/10=4,29=2,30=1,38=1/1,3;
2/12=2,40=1/2;
3/5=7,10=1,11=2,14=-4,16=1,17=8,25=1,30=1,71=2,74=-5,116=-2,140=1/1,2,3;
4/5=1/1;
5/5=2,38=6,98=1/2;
8/6=4,10=90,11=11/1;
10/13=10,15=4/2;
11/6=3,8=1,9=11,15=111,16=1/1,2,10;
10/6=1/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,18=1,28=1/1;
7/8=1,10=1,25=1/1,2,3,16;
1/10=4,30=1/3;
99//99;
---
0 2
---
Wanted an integer as input.
Found a string as input.
4ag pl                                                                          
  ?
Error termination via Lnk1e in E:\gs09\G09W\l101.exe at Fri Apr 10 12:12:28 2015.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes  0.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      5 Int=      0 D2E=      0 Chk=     19 Scr=      1



请详细解释下，谢谢了 辛苦各位前辈老师了
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菜鸟都不算

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1楼 2015-04-10 13:18:05
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菜鸟都不算

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by youyno at 2015-04-10 23:11:35
很明显是输入文件问题，要把输入文件贴出来，别人才好解决

不好意思呀，我是在用Gaussian打开out输出文件上进行编辑修改后在用Gaussian运行的
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3楼2015-04-12 19:24:48
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菜鸟都不算

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-04-13 09:27:29
不管你是用什么修改的
出错提示说的很明显了：
Wanted an integer as input.
Found a string as input.

需要整型输入，而你输入了一个字符串
所以仔细检查你输入文件对应的部分

谢谢 我再重新看看
赞一下 回复此楼
5楼2015-04-13 16:54:14
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菜鸟都不算

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-04-13 09:27:29
不管你是用什么修改的
出错提示说的很明显了：
Wanted an integer as input.
Found a string as input.

需要整型输入，而你输入了一个字符串
所以仔细检查你输入文件对应的部分

输入文件
%chk=E:\yb\fensaiqin\1ag\1ag pl.chk
#p b3lyp/Gen geom=check guess=read ExtraBasis Pseudo=Read freq=raman

1ag pl

0 1

C H N S
6-31++G(d,p)
****

ag 0
lanl2dz
****

ag 0
lanl2dz
输出文件

Entering Link 1 = c:\gaussian09w\l1.exe PID=     16348.
  
Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998,2003,2009, Gaussian, Inc.
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This is part of the Gaussian(R) 09 program.  It is based on
the Gaussian(R) 03 system (copyright 2003, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 98 system (copyright 1998, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 94 system (copyright 1995, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 92(TM) system (copyright 1992, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 90(TM) system (copyright 1990, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 88(TM) system (copyright 1988, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 86(TM) system (copyright 1986, Carnegie Mellon
University), and the Gaussian 82(TM) system (copyright 1983,
Carnegie Mellon University). Gaussian is a federally registered
trademark of Gaussian, Inc.
  
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Gaussian 09, Revision A.02,
M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria,
M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci,
G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian,
A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada,
M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima,
Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr.,
J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers,
K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand,
K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi,
M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross,
V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann,
O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski,
R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth,
P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels,
O. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski,
and D. J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.

******************************************
Gaussian 09:  IA32W-G09RevA.02 11-Jun-2009
                13-Apr-2015
******************************************
%chk=E:\yb\fensaiqin\1ag\1ag pl.chk
--------------------------------------------------------------------
#p b3lyp/Gen geom=check guess=read ExtraBasis Pseudo=Read freq=raman
--------------------------------------------------------------------
1/10=4,29=2,30=1,38=1/1,3;
2/12=2,40=1/2;
3/5=7,10=1,11=2,14=-4,16=1,17=8,25=1,30=1,71=2,74=-5,116=-2/1,2,3;
4/5=1/1;
5/5=2,38=6,98=1/2;
8/6=4,10=90,11=11/1;
10/13=10,15=4/2;
11/6=3,8=1,9=11,15=111,16=1/1,2,10;
10/6=1/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,18=1,28=1/1;
7/8=1,10=1,25=1/1,2,3,16;
1/10=4,30=1/3;
99//99;
Leave Link    1 at Mon Apr 13 16:52:38 2015, MaxMem=          0 cpu:       1.0
(Enter c:\gaussian09w\l101.exe)
------
1ag pl
------
No Z-matrix found on checkpoint file.
Cartesian coordinates read from the checkpoint file:
E:\yb\fensaiqin\1ag\1ag pl.chk
FileIO operation on non-existent file.
FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-20997 Len=          10 IPos=           0 Q=          2049404


dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles =    14 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =      622080 FType=2 FMxFil=10000

Number           0        501        502        598        989        991        992        993
Base         96256      23552      41472      44032      24576      37888      37376      23040
End         622080      24552      43525      44035      37076      41169      37381      23140
End1        622080      24576      44032      44544      37376      41472      37888      23552
Wr Pntr      96256      23552      41524      44032      24576      37888      37376      23040
Rd Pntr      96256      23552      41472      44032      24576      41169      37381      23140
Length      525824       1000       2053          3      12500       3281          5        100

Number         994        995        996        997        998        999
Base         20480      22528      21504      22016      20992      44544
End          20510      22538      21604      22071      21192      95796
End1         20992      23040      22016      22528      21504      96256
Wr Pntr      20480      22528      21504      22016      20992      44544
Rd Pntr      20510      22538      21604      22069      21192      45796
Length          30         10        100         55        200      51252


dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles =     1 SizExt =         0 WInBlk =       512
                   defal = F LstWrd =       67072 FType=2 FMxFil=10000

Number           0
Base         20480
End          67072
End1         67072
Wr Pntr      20480
Rd Pntr      20480
Length       46592


dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =     1 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =       67072 FType=2 FMxFil=10000

Number           0
Base         20480
End          67072
End1         67072
Wr Pntr      20480
Rd Pntr      20480
Length       46592
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

您看这个是怎么回事？谢谢老师指点
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6楼2015-04-13 17:02:10
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菜鸟都不算

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-04-14 08:03:53
你需要读取的chk文件不存在
请改成保存有你需要的结构的chk文件名。
或者你把包含空格的文件名打上双引号再试试...

谢谢老师  我试试  再跟您说
赞一下 回复此楼
8楼2015-04-14 10:05:44
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菜鸟都不算

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-04-14 08:03:53
你需要读取的chk文件不存在
请改成保存有你需要的结构的chk文件名。
或者你把包含空格的文件名打上双引号再试试...

我这个chk是在优化的结果out文件重新用gw保存改了名字和格式
赞一下 回复此楼
9楼2015-04-14 10:07:48
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菜鸟都不算

新虫 (小有名气)
送红花一朵
%chk=E:\yb\fensaiqin\1ag\1ag pl.chk
--------------------------------------------------------------------
#p b3lyp/Gen geom=check guess=read ExtraBasis Pseudo=Read freq=raman
--------------------------------------------------------------------
1/10=4,29=2,30=1,38=1/1,3;
2/12=2,40=1/2;
3/5=7,10=1,11=2,14=-4,16=1,17=8,25=1,30=1,71=2,74=-5,116=-2,140=1/1,2,3;
4/5=1/1;
5/5=2,38=6,98=1/2;
8/6=4,10=90,11=11/1;
10/13=10,15=4/2;
11/6=3,8=1,9=11,15=111,16=1/1,2,10;
10/6=1/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,18=1,28=1/1;
7/8=1,10=1,25=1/1,2,3,16;
1/10=4,30=1/3;
99//99;
Leave Link    1 at Tue Apr 14 10:35:28 2015, MaxMem=           0 cpu:         0.0
(Enter E:\gs09\G09W\l101.exe)
------
1ag pl
------
Structure from the checkpoint file:  "E:\yb\fensaiqin\1ag\1ag pl.chk"
FileIO operation on non-existent file.
FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-20997 Len=          10 IPos=           0 Q=          2289692


dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles =    14 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =      622080 FType=2 FMxFil=10000

Number              0           501           502           598           989           991
Base            96256         23552         41472         44032         24576         37888
End            622080         24552         43525         44035         37076         41169
End1           622080         24576         44032         44544         37376         41472
Wr Pntr         96256         23552         41524         44032         24576         37888
Rd Pntr         96256         23552         41472         44032         24576         41169
Length         525824          1000          2053             3         12500          3281

Number            992           993           994           995           996           997
Base            37376         23040         20480         22528         21504         22016
End             37381         23140         20510         22538         21604         22072
End1            37888         23552         20992         23040         22016         22528
Wr Pntr         37376         23040         20480         22528         21504         22016
Rd Pntr         37381         23140         20510         22538         21604         22072
Length              5           100            30            10           100            56

Number            998           999
Base            20992         44544
End             21192         95796
End1            21504         96256
Wr Pntr         20992         44544
Rd Pntr         21192         45796
Length            200         51252


dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles =     1 SizExt =         0 WInBlk =       512
                   defal = F LstWrd =       67072 FType=2 FMxFil=10000

Number              0
Base            20480
End             67072
End1            67072
Wr Pntr         20480
Rd Pntr         20480
Length          46592


dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =     1 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =       67072 FType=2 FMxFil=10000

Number              0
Base            20480
End             67072
End1            67072
Wr Pntr         20480
Rd Pntr         20480
Length          46592
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

我按照您的指点还是不行，这上面的是错误
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10楼2015-04-14 10:37:32
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菜鸟都不算

新虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-04-14 13:05:33
先确认你所指定的chk文件是否存在，可否用GV打开？
如果存在且能用GC打开，将其重命名，去掉里面的空格，再重新开始计算试试看。
如果不存在，找到你需要的chk文件，将其名字放进输入文件相关位置，或者重新跑一 ...

之前我是用gaussian打开优化后的文件进行编程后直接进行运算频率就可以了，但是会频率的输出文件覆盖优化的结果，拿给老师看说是因为没有频率的输入文件。就是那两个图片     然后告诉我说把优化的结果改名字存成gjf形式，把她以前的频率文件给我一份，但是我照着改完了之后进行高斯运算就出现上面的错误。  老师身体不好，家里事情多，基本上一两周见一次。    我也挺愚笨的，您辛苦了！特别感谢您
在接赝势原子优化后计算拉曼频率出现错误 刚运行就死
进行编写，修正.png


在接赝势原子优化后计算拉曼频率出现错误 刚运行就死-1
gaussian打开优化后的OUT文件.png
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    • 2015-04-16 12:50:06, 20.85 K
  • 附件 2 : 1ag.gjf
    • 2015-04-16 13:03:49, 1.49 K
  • 附件 3 : 老师给的频率输入文件.gjf
    • 2015-04-16 13:03:58, 191 bytes
  • 附件 4 : f1ag.gjf
    • 2015-04-16 13:04:29, 1.71 K
12楼2015-04-16 13:08:55
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菜鸟都不算

新虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-04-16 13:26:46
opt 和 freq 可以写在一起的，这样优化好之后会自动进行频率计算，就不会覆盖输出文件了...

是在#p b3lyp/gen guess=read geom=check extrabasis pseudo=read freq=raman上直接加一个opt吗
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14楼2015-04-17 15:19:33
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菜鸟都不算

新虫 (小有名气)
引用回帖:
15楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-04-17 15:22:02
是...

当前回帖不是应助回帖，您不能对此进行金币奖励哦
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16楼2015-04-17 15:38:58
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