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renyan0627铜虫 (小有名气)
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[求助]
求助各位老师同学，如何分析预测反应位点，万分感谢！ 已有1人参与
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求助各位老师同学，本人是食品专业研二学生，但最近要用到量子化学计算苯二酚和其亚硝基取代物的电荷分布，以判断其发生亲电取代的位点和取代先后顺序。 我看了Sob姐的“使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用”一文，其中以苯酚作为例子做了介绍，我觉得和我想做的很类似。 但是由于以前从未接触过量子化学，也对软件操作不了解，所以对于具体操作仍旧不是很清楚，想向各位老师同学求助。 在文中以苯酚举例时，输入关于C6H6O的每个原子数值，就得到苯酚.wfn，这个数值我怎么计算得到呢？比如我要得到邻苯二酚.wfn应该怎么做呢？ 后面得出了极大值点和极小值点的电荷数据，那如何得出苯环上每个碳原子的电荷数据呢？ 真诚希望各位老师同学可以提供帮助，在下万分感谢！ |
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2楼2015-04-03 06:26:39
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3楼2015-04-07 21:10:19
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谢谢您的回复。我目前遇到的问题是，在Gaussview中画好图，然后保存为gjf格式，然后在gaussian03w中打开，参数设置参照了原帖中苯酚的例子，但是在最下面的Molecule specification中它自动生成的数据是这样的： C C 1 B1 C 2 B2 1 A1 C 3 B3 2 A2 1 D1 C 4 B4 3 A3 2 D2 C 1 B5 2 A4 3 D3 H 1 B6 6 A5 5 D4 H 2 B7 1 A6 6 D5 H 3 B8 2 A7 1 D6 H 4 B9 3 A8 2 D7 H 6 B10 1 A9 2 D8 O 5 B11 4 A10 3 D9 H 12 B12 5 A11 4 D10 B1 1.39516000 B2 1.39471206 B3 1.39542701 B4 1.39482508 B5 1.39482907 B6 1.09961031 B7 1.09965530 B8 1.09968019 B9 1.09968011 B10 1.09960403 B11 1.43000000 B12 0.96000000 A1 120.00863221 A2 119.99416459 A3 119.99399231 A4 119.99845680 A5 120.00431986 A6 119.98077039 A7 120.01279489 A8 119.98114211 A9 120.00799702 A10 120.01134336 A11 109.50000006 D1 -0.05684321 D2 0.03411439 D3 0.03234809 D4 -179.97984142 D5 179.95324796 D6 179.96185208 D7 -179.99643617 D8 179.98917535 D9 -180.00000000 D10 89.93168724 1 2 1.5 6 1.5 7 1.0 2 3 1.5 8 1.0 3 4 1.5 9 1.0 4 5 1.5 10 1.0 5 6 1.5 12 1.0 6 11 1.0 7 8 9 10 11 12 13 1.0 13 然后我点击运行后，Gaussian一直运行到l703.EXE就又开始重复l101.exe，一直往复，就是不出结果。但是按照原帖中的复制过来，就重复一次就得到结果了。请问是我哪里操作错误还是也要得到像下图这样的数据再导入Gaussian吗？谢谢您  截图.png |
5楼2015-04-08 20:49:01
qchem
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7楼2015-04-08 22:20:29