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renyan0627

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助各位老师同学,如何分析预测反应位点,万分感谢! 已有1人参与

求助各位老师同学,本人是食品专业研二学生,但最近要用到量子化学计算苯二酚和其亚硝基取代物的电荷分布,以判断其发生亲电取代的位点和取代先后顺序。

我看了Sob姐的“使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用”一文,其中以苯酚作为例子做了介绍,我觉得和我想做的很类似。
但是由于以前从未接触过量子化学,也对软件操作不了解,所以对于具体操作仍旧不是很清楚,想向各位老师同学求助。

在文中以苯酚举例时,输入关于C6H6O的每个原子数值,就得到苯酚.wfn,这个数值我怎么计算得到呢?比如我要得到邻苯二酚.wfn应该怎么做呢?
后面得出了极大值点和极小值点的电荷数据,那如何得出苯环上每个碳原子的电荷数据呢?

真诚希望各位老师同学可以提供帮助,在下万分感谢!
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
renyan0627: 金币+15, ★★★★★最佳答案 2015-04-08 22:20:37
引用回帖:
5楼: Originally posted by renyan0627 at 2015-04-08 20:49:01
谢谢您的回复。我目前遇到的问题是,在Gaussview中画好图,然后保存为gjf格式,然后在gaussian03w中打开,参数设置参照了原帖中苯酚的例子,但是在最下面的Molecule specification中它自动生成的数据是这样的:
C ...

如果是结构优化那可能需要多次循环的

学Gaussian关键是要掌握每一个关键词是什么意思,每一行是什么意思

不然如果只是照着例子做,不理解的话,做再多也没用

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2015-04-08 21:21:41
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+1, 谢谢交流 2015-04-03 16:44:21
他那个应该很详细了呀

其实这个反应位点有结构化学的知识,肉眼就能看出来是哪,都不需要算

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2015-04-03 06:26:39
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renyan0627

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by qchem at 2015-04-03 06:26:39
他那个应该很详细了呀

其实这个反应位点有结构化学的知识,肉眼就能看出来是哪,都不需要算

后面步骤是很详细,主要是我不知道如何得到用于分析的wfn文件。
比如举的例子是打开苯酚.wfn文件进行计算,但如果我的是邻苯二酚或者是它的取代产物,我是先在什么软件里画出结构式再保存成这个wfn文件吗?用gaussview还是什么软件呢?
因为我不是学化学专业的,这些软件都是第一次接触,希望您能帮忙解释一下,谢谢!
求助各位老师同学,如何分析预测反应位点,万分感谢!
截图.png

3楼2015-04-07 21:10:19
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by renyan0627 at 2015-04-07 21:10:19
后面步骤是很详细,主要是我不知道如何得到用于分析的wfn文件。
比如举的例子是打开苯酚.wfn文件进行计算,但如果我的是邻苯二酚或者是它的取代产物,我是先在什么软件里画出结构式再保存成这个wfn文件吗?用gaus ...

用Gaussview画结构
然后用gaussian计算
计算的时候设置output=wfn

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2015-04-08 06:52:46
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