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[交流]
VASP计算任务中断，原因是reason = mpd disappeared,求解决办法。
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VASP计算一个任务，用计算机提交服务器进行计算，然后将SSH窗口关掉之后，再次登录任务就无故终端，log文件最后提示job aborted; reason = mpd disappeared。提交任务之前都需要在窗口上键入mpd &才能进行计算，之前求助过这个问题，是因为mpd不能自动启动，需要手动启动，但是为什么前端关闭，任务就结束了呢？我提交任务的命令是nohup mpirun -np 12 vaspmpi </dev/dull> log &, 已经让其后台运行了，为什么还中断呢？有人回答cannot connect to local mpd (/tmp/mpd2.console_hf); possible causes: 1. no mpd is running on this host 2. an mpd is running but was started without a "console" (-n option)In case 1, you can start an mpd on this host with: mpd & and you will be able to run jobs just on this host. 有人说我的并行安装有问题或者设置有问题，我安装MPI的步骤如下： MPI（mpich2-1.0.8）安装： 1. 进入进入指定目录/home/vasp52/mpi/（目录可以更改）下，进入后打开终端，输入以下命令进行安装： 解压 tar -zxvf mpich2-1.0.8.tar.gz（请使用这个版本，使用1.4版没有编译过）。 2. 进入安装包 cd mpich2-1.0.8 3. 输入命令 export F90=ifort FC=ifort 4. 检查环境指定目录 ./configure --prefix=/home/vasp52/mpich2/ --enable-f90 --enable-f77 （在configure的过程可能出现说域名错误，那就修改/etc/hosts文件） 5. 进行编译 make 6. 编译安装 make install 7. 修改环境变量 vi ~/.bashrc，加入以下两句 export PATH=/home/vasp/mpich2/bin/:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/home/vasp/mpich2/lib/:$LD_LIBRARY_PATH ulimit -s unlimited 8. 保存 source ~/.bashrc。 9. 输入命令： cd $HOME touch /etc/mpd.conf chmod 600 /etc/mpd.conf vi /etc/mpd.conf进入文本文档，输入secretword=123456（数字可以随意），保存退出。 再输入命令： mpd &就OK了。 输入以下命令：which mpd which mpiexec which mpdrun 能找到相对应的路径就说明没问题了。 求大神指点具体改进的方法！感激不尽！ 上一次求助的链接http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=8257344&fpage=1&target=self&page=1 |
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