24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2333  |  回复: 3

20130202

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助Mauve软件数据分析 已有1人参与

我利用Mauve2.3.1软件分析5个基因组序列,分别产生了一个.backbone和一个.bbcols文件,具体文件在附件里,这两个文件里的数据都是什么含义?怎么利用这些数据深入分析?求高手指点
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nanhu1984

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
20130202(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-03-30 20:57:26
20130202: 金币+9, ★★★很有帮助 2015-09-23 15:06:54
这个是做同源分析的,Mauve产生的数据文件,导入ClonalOrigin来计算水平基因转移频率
https://www.microbialgenomic.cn/
2楼2015-03-28 16:33:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

20130202

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by nanhu1984 at 2015-03-28 16:33:29
这个是做同源分析的,Mauve产生的数据文件,导入ClonalOrigin来计算水平基因转移频率

我主要是想找到这5个基因组的共有序列和特有序列及其功能,ClonalOrigin软件可以实现吗?
我网上说明书.backbone文件里的数据是核心基因组,就是我想要的共有序列的位点,但我不知道利用什么具体方法把这些位点方便的转换成我想知道的共有序列,因为数据量大,不可能手工校对。
此外,请问.bbcols文件里的数据什么含义?
3楼2015-03-30 16:42:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Berza

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 20130202 at 2015-03-30 16:42:56
我主要是想找到这5个基因组的共有序列和特有序列及其功能,ClonalOrigin软件可以实现吗?
我网上说明书.backbone文件里的数据是核心基因组,就是我想要的共有序列的位点,但我不知道利用什么具体方法把这些位点方 ...

请问楼主现在知道怎么找他们的共有序列和特有序列及其功能了么?求教求教啊
MADAMADADANE
4楼2016-07-23 21:27:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 20130202 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 303求调剂 +9 DLkz1314. 2026-03-30 9/450 2026-04-03 18:34 by ls刘帅
[考研] 315求调剂 +12 小羊小羊_ 2026-04-02 12/600 2026-04-03 18:22 by ls刘帅
[考研] 293求调剂 +5 末未mm 2026-04-02 6/300 2026-04-03 15:20 by 王保杰33
[考研] 334求调剂 +9 Trying] 2026-03-31 9/450 2026-04-03 15:18 by 琢珥丶
[考研] 085600专硕材料与化工348分求调剂 +10 上学啦! 2026-04-01 11/550 2026-04-03 14:13 by 百灵童888
[考研] 材料0856 英一数二 323 求调剂 +10 袁sy 2026-04-01 10/500 2026-04-02 19:52 by xingsh
[考研] 22408 266求调剂 +3 masss11222 2026-04-02 3/150 2026-04-02 18:11 by 笔落锦州
[考研] 348求调剂 +11 zzzzyk123 2026-04-01 11/550 2026-04-02 16:52 by Wang200018
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-04-02 3/150 2026-04-02 15:06 by cal0306
[考研] 材料化工340求调剂 +5 jhx777 2026-03-30 5/250 2026-04-02 12:45 by smileboy2006
[考研] 266分,一志愿电气工程,本科材料,求材料专业调剂 +10 哇呼哼呼哼 2026-04-01 11/550 2026-04-02 11:31 by lnilvy
[考研] 385分 生物学(071000)求调剂 +6 qf626 2026-04-01 6/300 2026-04-02 10:39 by guoweigw
[考研] 348环境工程调剂 +3 吴彦祖24k 2026-04-01 3/150 2026-04-02 09:14 by nanaliuyun
[考博] 26年申博 +3 staryer 2026-03-30 4/200 2026-04-01 23:21 by ai4pharm
[考研] 266分,一志愿电气工程,本科材料,求材料专业调剂 +10 哇呼哼呼哼 2026-04-01 11/550 2026-04-01 21:48 by chyhaha
[考研] 0703求调剂 +4 zizimo 2026-03-31 4/200 2026-04-01 16:04 by yanflower7133
[考研] 化学0703 调剂 306分 一志愿211 +12 26要上岸 2026-03-28 12/600 2026-04-01 11:10 by chemdavid
[考研] 085600,专业课化工原理,320分求调剂 +6 大馋小子 2026-03-29 6/300 2026-03-31 10:03 by 氯化亚硝酰
[考研] 323分 食品与营养调剂 +3 嘿ooo 2026-03-31 3/150 2026-03-31 09:38 by longlotian
[考研] 调剂考研 +3 王杰一 2026-03-29 3/150 2026-03-29 08:09 by fmesaito
信息提示
请填处理意见