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20130202

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助Mauve软件数据分析 已有1人参与

我利用Mauve2.3.1软件分析5个基因组序列，分别产生了一个.backbone和一个.bbcols文件，具体文件在附件里，这两个文件里的数据都是什么含义？怎么利用这些数据深入分析？求高手指点
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1楼 2015-03-26 13:37:39
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nanhu1984

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
20130202(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-03-30 20:57:26
20130202: 金币+9, ★★★很有帮助 2015-09-23 15:06:54
这个是做同源分析的，Mauve产生的数据文件，导入ClonalOrigin来计算水平基因转移频率
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https://www.microbialgenomic.cn/
2楼2015-03-28 16:33:29
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20130202

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by nanhu1984 at 2015-03-28 16:33:29
这个是做同源分析的，Mauve产生的数据文件，导入ClonalOrigin来计算水平基因转移频率

我主要是想找到这5个基因组的共有序列和特有序列及其功能，ClonalOrigin软件可以实现吗？
我网上说明书.backbone文件里的数据是核心基因组，就是我想要的共有序列的位点，但我不知道利用什么具体方法把这些位点方便的转换成我想知道的共有序列，因为数据量大，不可能手工校对。
此外，请问.bbcols文件里的数据什么含义？
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3楼2015-03-30 16:42:56
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Berza

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 20130202 at 2015-03-30 16:42:56
我主要是想找到这5个基因组的共有序列和特有序列及其功能，ClonalOrigin软件可以实现吗？
我网上说明书.backbone文件里的数据是核心基因组，就是我想要的共有序列的位点，但我不知道利用什么具体方法把这些位点方 ...

请问楼主现在知道怎么找他们的共有序列和特有序列及其功能了么？求教求教啊
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MADAMADADANE
4楼2016-07-23 21:27:06
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