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KEGG代谢途径画图
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anna_min
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专业: 食品加工技术
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KEGG代谢途径画图
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请问哪位大神知道下面的KEGG代谢途径图是用什么画的?
~2(3BRKO8}RY[~SENV%2EIB.png
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追求
1楼
2015-03-23 22:03:47
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jurkat.1640
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
anna_min: 金币+10,
★
有帮助, 我试着装过cytoscape 但是要求选择JAVA,没安装上
2015-03-24 13:33:44
cytoscape可以画
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2楼
2015-03-24 11:59:56
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xingzhou823
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性别: GG
专业: 生物信息学
【答案】应助回帖
这个图是pathway crosstalk图,需要计算两两pathway之间的关系值,然后选好阀值之后,使用cytoscape软件即可作图。
甚至可以比这个图还要漂亮。例如,设定节点的大小代表包含的差异基因个数;节点的颜色深浅代表与之相关的pathway多少;边的粗细代表p值。
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你,长大了吗?~有目的的希望小木虫不要倒闭
3楼
2015-03-24 13:35:25
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shengwukao
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注册: 2014-02-24
专业: 水产生物遗传育种学
引用回帖:
3楼
:
Originally posted by
xingzhou823
at 2015-03-24 13:35:25
这个图是pathway crosstalk图,需要计算两两pathway之间的关系值,然后选好阀值之后,使用cytoscape软件即可作图。
甚至可以比这个图还要漂亮。例如,设定节点的大小代表包含的差异基因个数;节点的颜色深浅代表与 ...
请问这个关系值怎么计算的,怎么得到pathway之间的相互作用呢
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4楼
2017-03-29 17:30:56
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